分子生态学名词解释.doc

一、翻译并解释名词:(10x4分)
allele 等位基因
一个位点的序列变异。
Effective population size (Ne) 有效种群大小
在一个具有相等性比、随机交配的理想种群中表现出与特定统计(全部成体数目)规模相对应的真实的种群杂合性随时间丧失的速率相同的个体数。
F-statistics F 统计检验
用于评估个体间、亚种群间和整个种群间杂合性的分布的统计方法,被广泛应用于定量亚种群的遗传分化。
ic load 遗传负荷
相对于理论最佳值来说降低了的基因型适合度。
Hardy-Weiberg equilibrium哈温平衡
当所有等位基因频率是已知的时候,在一个大的随机交配种群中的纯合子和杂合子的预期比例。假设没有迁移、突变或选择作用,哈温平衡定律则认为等位基因频率从一个世代到下一个世代应该保持不变。
Bottleneck effect瓶颈效应
种群的规模大为缩小,随后常常有一个(种群的)恢复。
Selection sweep选择扫荡。
课件:Occurrence of a beneficial mutation,Only individuals carrying the mutation reproduce,‘Population bottleneck’,Mainly affects linked loci。
IAM 无限等位基因模型
其中突变不是以可预料的方式一个接一个发生,而大多数突变是像产生SNP(单核苷酸多态性)那样出现的。
Linkage disequilibrium (LD) 连锁不平衡。
术语表:
Linkage equilibrium 连锁平衡:由重组促成的情形,其中遗传位点在繁殖期相互独立分离。当两个位点上的等位基因一起分离时,如他们在同一个染色体上的物理位置太接近时,则发生不平衡。
百度:
连锁平衡:HLA 不同基因座位的各等位基因在人群中以一定的频率出现。在某一群体中,不同座位上某两个等位基因出现在同一条染色体上的频率高于预期的随机频率的现象,称连锁不平衡(linkage disequilibrium) 。由于 HLA 不同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传,而连锁的基因并非完全随机地组成单体型,有些基因总是较多地在一起出现,致使某些单体型在群体中呈现较高的频率,从而引起连锁不平衡。
Metapopulation复合种群
种群再分为多个同类群,至少其中的一些偶尔灭绝,随后通过从其他同类群迁入再建立种群。
Microsatellite微卫星
带有单序列(通常为2-,3-或4-核苷酸)重复多次的遗传位点。
MtDNA 线粒体DNA
存在于线粒体中的环状染色体。
Non-synomous mutation非同义突变
由一个三联密码变化使特定氨基酸改变的突变。
PCR聚合酶链式反应
用寡核苷酸引物和耐热的DNA聚合酶扩增大量DNA序列的一种方法。
SNP单核苷酸多态性
在DNA序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸碱基的等位基因。
RFLP限制性片段长度多态性
用限制性酶和凝胶电泳鉴定DNA序列多态性的方法。
Transition转换
一个嘌呤核苷酸被另一个嘌呤核苷酸替代,或一个嘧啶核苷酸被另一个嘧啶核苷酸取代的突变。
Trans