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柑橘木虱转录组分析及与柑橘黄龙病病原菌互作的初步研究的中期报告.docx
文档分类:
医学/心理学
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柑橘木虱转录组分析及与柑橘黄龙病病原菌互作的初步研究的中期报告.docx
该【柑橘木虱转录组分析及与柑橘黄龙病病原菌互作的初步研究的中期报告 】是由【niuwk】上传分享,文档一共【2】页,该文档可以免费在线阅读,需要了解更多关于【柑橘木虱转录组分析及与柑橘黄龙病病原菌互作的初步研究的中期报告 】的内容,可以使用淘豆网的站内搜索功能,选择自己适合的文档,以下文字是截取该文章内的部分文字,如需要获得完整电子版,请下载此文档到您的设备,方便您编辑和打印。柑橘木虱转录组分析及与柑橘黄龙病病原菌互作的初步研究的中期报告本研究旨在通过转录组分析研究柑橘木虱与柑橘黄龙病病原菌的互作机制。本次报告为中期报告,主要介绍了实验的样本采集、RNA提取、测序和数据分析等内容。一、样本采集和RNA提取本研究采集了柑橘木虱(Diaphorinacitri)的幼虫和成虫两种生物阶段的样本,每个阶段各三个重复。另外,还采集了柑橘树叶片、柑橘木虱在柑橘树叶片上摄食的部位和柑橘黄龙病病原菌(CandidatusLiberibacterasiaticus)感染的柑橘树的根、茎、叶片和果实等不同组织的样本。所有样本均采用RNAisoPlus试剂盒(Takara)提取总RNA,并经过DNaseI酶处理去除DNA污染。RNA的质量和纯度均通过NanoDrop2000分光光度计和2100Bioanalyzer检测合格。RNA样品的详细信息见附表1。二、测序和数据分析将符合要求的RNA样品构建cDNA文库,并通过IlluminaHiSeqXTen平台进行高通量RNA测序(双端150bp)。经过质控和过滤,。将原始数据比对至柑橘(Citrussinensis)的基因组上,并使用featureCounts软件计算每个基因的表达量。根据表达量筛选不同iallyexpressedgenes(DEGs),并对DEGs进行GO(GeneOntology)和KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)富集分析,以探究柑橘木虱与柑橘黄龙病病原菌互作的潜在分子机制。三、预期结果通过本次研究,我们预期可以鉴定到柑橘木虱和柑橘黄龙病病原菌互作所需要的DEGs,并进一步研究这些DEGs在互作过程中的表达和调控机制,为研究柑橘木虱和柑橘黄龙病病原菌互作的分子机制提供新的线索。
柑橘木虱转录组分析及与柑橘黄龙病病原菌互作的初步研究的中期报告 来自淘豆网www.taodocs.com转载请标明出处.
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