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第四章-3D构型图-Weblab Viewer.ppt

文档分类：高等教育 | 页数：约135页举报非法文档有奖

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第四章、三维构型图的创建- WebLab Viewer 使用 1. 软件简介 Weblab Viewer 软件是美国 MSI( Microcal Software Inc.) 公司开发的用于物质构型图形化( 构型建模) 软件,主要用于化学三维结构显示与构造。该软件为商业化软件,主要功能如下: ?化学结构的绘制:包括原子、化学键等基本绘制功能; ?构型测量功能:包括计算键长、键角、二面角、分子体积以及表面面积等; ?晶体结构构造:通过定义晶格参数和对称性(空间群编号)后,可构造晶体结构,也可直接读取实验晶体结构测量所得到的 cif文件; 黄铁矿 PbI2 ?较强的 3D显示功能:构型显示方式包括线、棒、球—棒、多面体堆积,以及多个构型文件的动画显示等; ?提供蛋白质结构工具:包括蛋白质的线状、棒状、扁平带、实心带等多种显示方式。 HIV 蛋白酶 2. 软件主要使用方法(1) 操作界面菜单栏快捷方式工具条编辑区提示信息栏?菜单栏说明文件菜单:用于文件操作和打印等 www. rcsb .org/ pdb / 所支持的文件类型: 默认文件( msv )晶体结构文件( cif) x,y,z 坐标文件( xyz) ISIS/draw 文件( skc ) 其中 xyz 文件较为常用, skc 文件也可由 Chemdraw 产生编辑菜单:用于构型的复制和粘贴等可将构型复制到 word 文档中(为避免所创建的文档过大,通常较少采用直接复制的方法)察看原子、化学键或分子性质

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