non-coding RNA——现代分子生物学课程.ppt

Noncoding RNA
海南大学
园艺园林学院
RNA的研究进展
RNA组学:通过对 R N A的研究所取得的巨大成果而形成了 R N A组。
RNA研究已有百余年的历史,其间有两个阶段时期。
第一个阶段:20世纪的 50 ~ 60年代,各种RNA开始被发现,但对RNA的认识还不深入。
第二个阶段:20世纪的 80年代,RNA的功能逐渐被发现,越来越多的研究表明RNA在遗传方面的重要作用。
Non-coding RNA(非编码RNA)
非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。其中包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等多种已知功能的 RNA,还包括未知功能的RNA。这些RNA的共同特点是都能从基因组上转录而来,但是不翻译成蛋白,在RNA 水平上就能行使各自的生物学功能了。
分类
非编码RNA 从长度上来划分可以分为3类:
小于50 nt,包括microRNA,siRNA,piRNA;
50 nt到500 nt,包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA,SLRNA,SRPRNA 等等;
大于500 nt,包括长的mRNA-like 的非编码RNA,长的不带polyA 尾巴的非编码RNA等等。
根据亚细胞定位可将非编码 RNA 分为:
细胞核非编码 RNA 与细胞质非编码 RNA。
根据是否具有polyA尾结构可将非编码RNA分为
具有polyA 尾的非编码 RNA(polyA-plus ncRNAs)和不具有 polyA 尾的非编码 RNA(polyA-minus ncRNAs。
根据转录本的长度可将非编码 RNA 分为
小非编码 RNA 和长链非编码 RNA。
分类
根据生物学功能可将非编码 RNA 分为:
持家非编码 RNA 和调控性非编码 RNA。持家非编码RNA 主要包括核糖体 RNA(rRNA)、转运 RNA(tRNA)、小核 RNA (snRNA)、小核仁 RNA(snoRNA)、引导RNA(gRNA)和端粒酶 RNA; 调控性非编码RNA主要包括小干扰 RNA(siRNA)、微小 RNA(microRNA)、与 Piwi蛋白相互作用的 piRNA 和长链非编码 RNA (lncRNAs)。
分类
调控非编码RNA:长链非编码RNA (lncRNA)
短链非编码RNA(siRNA、miRNA、piRNA)
非编码RNA
看家非编码RNA
调控非编码RNA
长链非编码RNA (lncRNA)
长链非编码RNA通常是指长度大于200个核苷酸的非编码 RNA 转录本。该概念是在 2002 年由日本科学家首次提出, 他们在小鼠全长 cDNA 文库的大规模测序中, 鉴定了大量较长的非编码RNA转录本。
短链非编码 RNA(siRNA、miRNA、piRNA)
它们的转录本序列都比较短,不超过 40 nt 短链非编码 RNA 分子虽小,却参与了包括细胞增殖、分化、凋亡、细胞代谢以及机体免疫在内的几乎所有生命活动的调节和控制,在生命体内扮演着至关重要的角色。
长链非编码RNA (lncRNA)
lncRNA不参与或很少参与蛋白编码功能, 位于细胞核内或胞浆内。
近年来的研究表明,lncRNA参与了X 染色体沉默、染色体修饰和基因组修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等过程,其调控作用正在被越来越多的人研究。