下载此文档

非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用的制作方法.docx


文档分类:医学/心理学 | 页数:约13页 举报非法文档有奖
1/13
下载提示
  • 1.该资料是网友上传的,本站提供全文预览,预览什么样,下载就什么样。
  • 2.下载该文档所得收入归上传者、原创者。
  • 3.下载的文档,不会出现我们的网址水印。
1/13 下载此文档
文档列表 文档介绍
该【非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用的制作方法 】是由【开心果】上传分享,文档一共【13】页,该文档可以免费在线阅读,需要了解更多关于【非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用的制作方法 】的内容,可以使用淘豆网的站内搜索功能,选择自己适合的文档,以下文字是截取该文章内的部分文字,如需要获得完整电子版,请下载此文档到您的设备,方便您编辑和打印。非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用的制作方法非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用的制作方法本发明公开了一种非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用。一种人体血清/血浆中稳定存在的非小细胞肺癌预后标志miRNA组合,由miR‐638和miR‐27a组成。检测所述的非小细胞肺癌预后标志miRNA组合的引物和探针组合物,由美国应用生物系统公司生产的货号为ABI?assay?ID000200的miR‐638引物和荧光探针和美国应用生物系统公司生产的货号为ABI?assay?ID001582的miR‐27a引物和荧光探针组成。将筛选出的特定血清/血浆miRNA作为新型的肺癌标记物,该方法可广泛用于非小细胞肺癌的预后判断和疗效监测,其对非小细胞肺癌的预后判断的准确性明显高于已报道的血清miRNA。【专利说明】非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用【技术领域:】[0001]本发明属于生物检测领域,涉及一种非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用。【背景技术:】[0002]肺癌是全世界最常见的恶性肿瘤,也是癌症相关死亡的首位死因。每年确诊的肺癌病例约161万例,%,肺癌相关死亡约138万例,%。肺癌也是我国最常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率在中国大多数地区占第一位,在大城市及工业污染重的地区尤为显著。随着中国人口的持续增长和人口老龄化的加剧,加之生活方式、社会、经济和环境等因素的改变,肺癌的发病率和死亡率呈明显上升趋势。[0003]根据不同的肺癌细胞形态,可将肺癌分为两大类,非小细胞肺癌(non-smallcelllungcancer,NSCLC)和小细胞肺癌(smallcelllungcancer,SCLC),非小细胞肺癌占所有肺癌病例的80%~85%,由于大多数患者在患病早期没有明显的症状,确诊时多已进人中晚期阶段,治疗效果及预后较差。缺乏有效的早期诊断方法和晚期肺癌治疗效果不佳是导致肺癌患者预后不良的主要原因。既往肺癌早期诊断常用的方法是影像学检查、血清标志物或者痰液细胞学检查。但敏感性和特异性均低;以被修饰的细胞为目标的靶向治疗则需要知道精确的癌细胞分类,但这仅依靠常规的组织病理学诊断技术是远远不够的。[0004]微小RNA(microRNA,miRNA)是一类新发现的非编码单链小分子RNA,通常是由RNA聚合酶II转录。成熟的微小RNA保留在具有功能的复合体中,通过与靶mRNA的3’非翻译区结合(3untranslatedregion,3一UTR)结合,抑制mRNA的翻译或影响mRNA的稳定性而发挥作用。广泛参与机体的生长发育、细胞的代谢、增殖、分化、凋亡和肿瘤形成等生理和病理过程,已成为生命科学界研究的热点。新近研究发现,微小RNA在人类的多种疾病中,包括肿瘤的病理过程中发挥重要作用。微小RNA表达与多种癌症相关,微小RNA可以起“癌基因”或者“抑癌基因”的功能,大约50%已阐明的微RNA在基因组上定位于与肿瘤相关的脆性位点(fragilesite)。这说明微小RNA在肿瘤发生、发展过程中起了至关重要的作用。[0005]miRNA的表达具有时空特异性。在不同组织与不同发育阶段中miRNA的水平有显著差异,miRNA在不同肿瘤中具有特定的表达模式,这为肿瘤的基因诊断提供了一种新方法。由于肺癌的发生受环境、遗传等多因素影响,其中miRNA在肺癌的早期诊断和治疗中发挥着重要的作用。[0006]越来越多的研究证明,血清miRNA的表达谱在预测肺癌的发展和预后中具有重要价值。RaponiM[1]检测了61例肺鳞癌患者以及与之匹配的正常肺组织样本,发现有15种miRNAs存在表达差异,包括著名的miR-17-92簇。目前,miR-155、let-7和miR-146b被证明在肺腺癌中具有较高的预后判断价值,特别是miR-146b对预后的指示准确率可达到78%。CaoWm研究证明,miR-21、miR-143以及miR-181a可作为NSCLC分子诊断及预测预后的生物标记物。Yanaihara等M运用RT-PCR及Kaplan-Meier分析显示:has-mir-155前体高表达或者has-mir-let-7a-2前体低表达的肺腺癌患者预后差。另外,slva等[4]采用芯片技术检测发现,血清miR-30-3P和let-7f的水平与肺癌患者的无病生存率和总生存率显著相关;血清miR-30-3P和let-7f的高水平表达提示肺癌患者预后不良。但是,到目前为止,尚缺少对化疗或放疗前后肺癌患者血液中的miRNA改变的检测研究数据,以及尚未有详细的关于用于疗效评估的有关理想miRNA及其组合的报道,从而可以将miRNA检测用于肺癌患者的个体化治疗。【发明内容】[0007]本发明的目的是针对现有技术的上述不足,提供非小细胞肺癌预后检测组合物。[0008]本发明的另一目的是提供所述组合物的应用。[0009]本发明的目的可通过如下技术方案实现:[0010]一种人体血清/血浆中稳定存在的非小细胞肺癌预后标志miRNA组合,由miR-638和miR-27a组成。[0011]检测所述的非小细胞肺癌预后标志miRNA组合的引物和探针组合物,由美国应用生物系统公司生产的货号为ABIassayID000200的miR-638引物和荧光探针和美国应用生物系统公司生产的货号为ABIassayID001582的miR-27a引物和荧光探针组成。[0012]所述的组合物在制备非小细胞肺癌预后检测试剂中的应用。[0013]一种非小细胞肺癌预后检测试剂盒,包含本发明所述的组合物。[0014]有益效果:[0015](I)将筛选出的特定血清/血浆miRNA组合作为新型的肺癌标记物,该方法可广泛用于非小细胞肺癌的预后判断和疗效监测,其对非小细胞肺癌的预后判断的准确性明显高于已报道的血清miRNA。[0016](2)血清/血浆miRNA组合作为新的疾病标记物,可改变单一的疾病标记物所难以克服的低特异性和低灵敏度,提高疾病的检出率和监测临床预后。[0017](3)血清/血浆miRNA组合检测技术的优势在于其检测的是一系列疾病相关标记物,能个克服由个体因素引起的差异,而这是单一疾病标记物说无法逾越的一个主要障碍。可以用于肺癌的临床治疗疗效判断,从而可以为临床提供选择合适的治疗方案,达到个体化的抗肿瘤治疗。【专利附图】【附图说明】[0018]图1DDP作用下SPC-Al细胞的凋亡率随时间变化[0019]*P〈,与对照组比较;.P〈,与24h处理组比较;ΛP〈,与24h处理组比较?Ρ〈,与48h处理组比较。[0020]图2DDP作用后SPC-Al上清中miR-638相对表达水平比较[0021]*Ρ〈,与对照组比较[0022]图346例NSCLC患者DDP化疗后miR-638水平较化疗前变化情况。[0023]26例患者化疗后血清中miR-638水平较化疗前上升,20例较化疗前水平下降,Y轴>1为表达水平升高,Y轴〈-1为表达水平降低。[0024]图4Kaplan_Meier生存曲线分析。[0025]miR-638表达升高者与表达下降者生存期存在显著差异,表达升高者生存期较下降者明显延长(P〈)。[0026]图5SPC-A1细胞凋亡率随时间变化[0027]图6SPC-A1培养上清中不同时间段miR_27a含量(对照组比较,*,P〈)[0028]图7SPC-A1培养上清中miR_27a含量随时间变化[0029]图8SPC-A1细胞内不同时间段miR_27a含量(对照组比较,*,P〈)[0030]图9SPC-A1细胞内miR_27a含量随时间变化[0031]图10肺癌患者血清miR_27a的相对含量化疗前与化疗后比较[0032]图11不同疗效组肺癌患者化疗前血清miR_27a的相对含量比较[0033]图12不同疗效组肺癌患者化疗后血清miR_27a的相对含量比较[0034]图13PR组肺癌患者化疗前后血清miR_27a的相对含量比较[0035]图14NR组肺癌患者化疗前后血清miR-27a的相对含量比较[0036]图15血清miR-27a化疗后变化趋势,Kaplan-Meier生存曲线分析[0037]图164例接受3~4周期化疗的晚期肺癌患者血清miR-27a相对含量动态变化结果[0038]图17NSCLC患者及健康体检者miR-638相对表达水平[0039]图18NSCLC患者及健康体检者miR_27a相对表达水平[0040]图19NSCLC患者化疗前后miR-638相对表达水平[0041]图20NSCLC患者化疗前后miR_27a相对表达水平[0042]图21NSCLC患者化疗后miR-638变化及生存曲线分析[0043]图22NSCLC患者化疗后miR_27a变化及生存曲线分析【具体实施方式】[0044]实施例1[0045]细胞培养及体外实验=SPC-Al细胞株(购自中科院上海细胞库)生长于含有10%FBS的RPMI1640培养基(购自Hyclone公司)中,取对数期细胞接种于6孔板,2XIO5/孔,待细胞生长贴壁后,Hanks液洗涤,加含5μg/ml顺钼(购于山东齐鲁制药厂)的RPMI1640培养液分别作用24h、48h、72h,37°C,5%C02条件下培养。同时设置对照组(不加DDP),每组各设3复孔。收集各组各时间点对应上清,冻存于_70°C。独立试验重复3次。[0046]细胞凋亡率的测定:收集上述各组各时间点SPC-Al细胞,用冷I3BS洗两遍,调整成终浓度为IXIOVmL的单细胞悬液,取IXIO5细胞悬液,加入5μLAnexinV-FITC和5μLPI,轻轻混匀,室温避光反应15min,再加入400μL标记缓冲液,流式检测细胞凋亡率。[0047]血清样本:临床血清样本来自2009年I月至2012年12月期间在南京医科大学第一附属医院住院的NSCLC患者46例,所有患者均经病理学诊断证实为NSCLC,男性患者29例,中位年龄64岁;女性患者17例,中位年龄52岁,临床资料祥见表1,均接受顺钼方案化疗一周期及以上,以总生存期作为最终评价指标,即自确诊之日起至末次随访或患者死亡日期止。[0048]RNA提取及RT-PCR:采用miRNeasyMiniKit(美国Qiagen公司)分别提取SPC-A1培养上清和临床血清样本中的RNA,以外源性cel-mir-39(cel-mir-39,5’-ggguguaaaucagcuug-3’)作为内参照(miR-39引物(ABIassayID000408))。逆转录反应采用ABI公司的microRNA逆转录试剂盒及特异性莖环结构(steam-loop)引物(即miR-638引物(ABIassayID000200)),总体系为15μ1,,,,reversetranscriptaselμI,5XPrimemir-638/cel-mir-39各L5μ1,。反应条件:16°C30min,42°C30min;85°C5min;4°C冷却。RealtimePCR采用ABI公司的特异性Taqman探针及基因扩增试剂和7500型基因扩增仪,总体系10μI,其中5μ12XTaqmanGeneExpressionMasterMix,,,2μIcDNA模板。扩增条件:95°C预变性IOmin,95°C15s,60°C退火延伸lmin,45个循环。扩增结果mir-638相对表达量采用公式Ca/Cb=2AGtb_AGta(ΛCt=Ctmir_638-Ctcel_mir_39)计算。(a、b为两个不同样本)[0049]统计学方法:。各组间细胞凋亡率的比较采用AN0VA,MannWhitney-U非参数检验比较药物处理前后miR-638的表达水平。采用X2检验或Fisher’s确切概率法分析临床样本中miR-638表达模式和NSCLC临床病理参数的关系,预后分析采用Kaplan-Meier生存分析和log-rank检验进行分析,)。对照组miR-27a含量在72h含量升高,与其他各时间段比较,差异均有显著性(P均〈)。DDP()组miR-27a含量在12h、24h、48h和72h逐渐升高,两两比较差异均有显著性(P均〈)(图7)。[0062]SPC-Al细胞内miR-27a含量:DDP()组miR_27a含量在12h、24h、48h和72h均显著高于对照组,差异有显著性(P均〈)(图8)。对照组miR-27a含量在12h、24h、48h和72h均无显著变化,两两比较差异无统计学意义(P均>)。)组miR-27a含量在24h、48h和72h均显著高于12h,差异有显著性(P均〈);但24h、48h和72h含量无显著变化,两两比较差异无统计学意义(P均>)(图9)。[0063]miR-27a在DDP诱导的SPC-Al细胞凋亡中表达升高,提示其参与肺腺癌细胞凋亡调控。[0064]实施例3[0065]研究对象:26名晚期肺癌患者来自2010年3月至2012年5月南京医科大学第一附属医院科,男16名,女10名,年龄31~77岁(中位年龄:61岁)。均为初诊肺腺癌患者,无法进行根治性手术,未经放、化疗等治疗。肺癌的诊断均经组织病理学检查证实。患者接受一线或二线药物化疗,一线药物化疗方案多西他赛加顺钼,二线化疗药物为培美曲塞。患者中有7位完成3~4周期的一线药物化疗,其余15位完成I~2个周期的短期化疗。每个化疗周期结束后参考RECIST标准进行一次疗效评价,患者随访至2013年3月。[0066]化疗疗效评判每个化疗周期根据影像学检查结果,依据RECIST标准进行一次。具体标准如下:完全缓解(CR):所有非目标病灶消失和肿瘤标志物水平正常;部分缓解(PR):基线病灶长径总和缩小>30%;病情进展(PD):基线病灶长径总和增加>20%、绝对值增大5mm或出现新病灶;病情稳定(SD):基线病灶长径总和有缩小但未达PR或有增加但未达H),一个或多个非目标病灶和/或肿瘤标志物高于正常持续存在。本研究中,一线药物化疗后,采取患者最好化疗效果确定其疗效分组。[0067]样本采集与处理:接受3~4周期化疗的7位患者分别于化疗前I~7d及每次化疗周期用药结束后I~2d采集静脉血。旨在监测短期血清miR-27a水平变化的19位患者于首次化疗前I~7d及首个化疗用药后I~2d采集静脉血。使用分离胶促凝管采集患者肘部静脉血2mL,3000rpm/min离心5分钟,分离上层血清,再于4°C16000g离心IOmin,分装上层血清每管200μI于样本保存管中,涡旋混匀后置_70°C保存待测。上述操作于样本采集后2小时内完成。QIAzoI试剂法提取血清RNA。[0068]miR_27a逆转录反应:使用2720型基因扩增仪在同一反应管中同时逆转录目的基因miR-27a和参比基因cel-miR-39。每个反应体系包括miR_27a5Xprimer(ABIassayID001582);cel-miR-395Xprimer(ABIassayID000408);IOOmmol/;50U/μLreverseTransonpraselμL;;;;总体系15μL。逆转录反应条件同实施例2。[0069]双重荧光定量PCR检测miR_27a相对含量:使用ABI7500荧光定量PCR扩增仪在不同反应管中同时扩增目的基因miR-27a和参比基因cel_miR-39。每个反应体系包括miR-27a20X引物(ABIassayID001582带荧光探针);cel-miR-3920Xprimer(ABIassayID000408);2Xmix5μL;

非小细胞肺癌预后检测组合物及其应用的制作方法 来自淘豆网www.taodocs.com转载请标明出处.

相关文档 更多>>
非法内容举报中心
文档信息
  • 页数13
  • 收藏数0 收藏
  • 顶次数0
  • 上传人开心果
  • 文件大小25 KB
  • 时间2024-04-13