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复旦研究生-2010-4.ppt.ppt

文档分类：研究生考试 | 页数：约59页举报非法文档有奖

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文档列表 文档介绍

BLASTBasic Local Alignment Search Tool
分子数据库检索
BLAST 流程
QLNFSAGW
QL
LN
NF
FS
SA
AG
GW
QL=11, QM=9, HL=8, ZL=9
LN=9, LB=8
NF=12, AF=8, NY=8, DF=10,…
…
…
...
...
w
T
BLAST可搜索库
统计计算
Neighbourhood Word
Hit extension
(击中延伸)
根据阈值决定终止点
生成输出文件
序列库
W为字长 ., 2
T为阈值(score) ., 8
.gov/BLAST
新版界面
BLAST系列程序选择流程
蛋白质序列?
是
蛋白质数据库?
是
blastp
否
蛋白质数据库?
tblastn
否
否
blastn
是
否
tblastx
blastx
是
数据库翻译?
查询序列
BLASTp
BLAST ID
BLAST 结果(1 - 5)
1
2
3
4
5
BLAST 结果(1)
BLAST 结果(2)

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