小鸡毛囊细胞再生要点.docx

转录组的小囊禽流感内耳毛细胞的再生
Yuan-Chieh Ku,1妮可•a•Renaud 1 a . Veile上升,辛西娅•赫尔姆斯1 . Voelker,马克•e•Warchol 2和迈克尔Lovett1
1遗传学和2耳鼻咽喉部,华盛顿大学医学院,圣路易斯,密苏里州63110
感觉毛细胞丢失是听觉和平衡失调的主要原因。哺乳动物是无法持续的头发细胞再生,但较低的脊椎动物这些mechano-electrical传感器可以再生。我们现在第一个全面的转录组(通过信使rna - Seq)小鸡毛细胞再生的小囊。我们提供途径和模式注释与表型关联这些事件发生在再生。这些模式是惊人的同步和高度打断。我们展示这些模式是如何识别组件的新资源的头发细胞转录组和识别494个新假定毛细胞具体基因和验证三种免疫组织化学染色(三个测试)。我们描述了许多令人惊讶的新组件和动态表达模式,尤其是在NOTCH信号。例如,我们表明,HES7明确表示在小囊毛细胞再生和密切的相似之处HES5的表达。同样,ATOH1的表达与HEYL密切相关,通过抑制转录因子ID1、ID2,ID4。我们研究纤维母细胞生长因子信号之间的相关性和支持细胞增殖和显示FGF20支持细胞增殖抑制。我们也提供了一个分析212个差异表达的转录因子基因在再生时间进程,分为9个不同的基因表达模式,其中许多与表型事件在再生和代表有吸引力的候选人未来的分析和操作的感觉上皮细胞和其他脊椎动物neuroepithelia再生项目。
关键词:毛细胞;再生;RNA-seq;系统生物学;胞果
介绍
失去感觉毛细胞是听觉和平衡失调的主要原因(Marazita等人,1993; Blanchfield等人.,2001)。感觉毛细胞驻留在感觉上皮细胞转导声音和运动。在哺乳动物中,一旦这些上皮细胞成熟,他们不能持续再生(打造et人,1993; Warchol等人.,1993);然而,降低脊椎动物有一个健壮的regenera——这个能力在他们的感觉上皮细胞(科文和Cotanche,1988;瑞尔斯和鲁贝尔,1988;Warchol科文,1996)。禽流感毛细胞死亡触发两种结果之一周围支持细胞。他们可以直接转换成新的毛细胞(罗伯森et人,2004;邓肯等人.,2006),这一过程被称为表型转换,或者他们可以进入细胞周期产生新的毛细胞和支持细胞再生pro - liferation(吉伦特等.,1989;石头和Cotanche,1994)。在脊椎动物的耳朵,前庭(平衡)和耳蜗毛细胞(听觉)系统依赖于机械运动转换成电刺激。前庭系统mor-phologically保存在不同的脊椎动物物种中,而哺乳动物的听觉系统已经进化专业struc - 温度没有出现在其他脊椎动物(迈耶斯科文,2008)。
作者的贡献:;Y.-。,随机变数,简历进行研究;Y.-。,天然橡胶,h,;Y.-。,.,马丁写的论文。
这项工作是由美国国立卫生研究院(赠款RC1DC010677马丁和R01DC006283
)。作者声明没有竞争的经济利益。
信件应该写给教授迈克尔•洛维特NHLI,竹荚鱼大楼,帝国理工学院Dovehouse街,伦敦SW3 6光年电子邮件:m.******@。
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版权©2014年作者0270 - 6474/14/343523 - / 0
  知之甚少的遗传机制,调节感觉上皮细胞再生。一个例外是NOTCH通路,它一直在研究哺乳动物和鸟类都在开发和再生毛细胞(林德-出售et人,1996;兰福德等人.,1999;石头和鲁贝尔,1999)。这样的研究表明,基因转录因子ATOH1和各种他扮演了一个重要的角色在决定通过相互抑制毛细胞和支持细胞命运循环。值得注意的是,这些转录因子和下游的上游管理机制,进一步指定一个毛细胞在很大程度上是未知的。
  我们小组进行了第一次大规模的基因表达分析再生过程的禽流感内耳specif——专注于带转录因子基因表达的变化——锡安(霍金斯et人.,2007)。在这里,我们目前的第一个全面的转录组,由RNA-Seq毛细胞再生的小鸡小囊acrossa7d时间进程从第一阶段的应对伤害到生产新的毛细胞的再生增殖。我们提供大量的途径和模式注释和相关基因表达数据与支持细胞的增殖,生产新的毛细胞的表型转换,和后来的生产重新生成扩散的毛细胞。我们还描述了主要明显的帕特-燕鸥和途径,其中一些是令人惊讶和动态和展示这些新发现资源准确一致格——彻底的