基于生物信息学与生物技术开发植物分子标记的研究进展.pdf

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基于生物信息学与生物技术开发植物分子标记的研究进展专题介绍戚粕星餖齝∞摘要各种序列数据库的迅猛增长与生物信息软件的不断开发使基于序列资源的标记开发更加便捷,各类分子生物学技术的涌现及高通量检测平台的建设为实验室开发分子标记提供了强有力的技术支持。本文从生物信息学角度概述了等分子标记开发的方法、特点及应用现状,并介绍了利用分子生物技术开发昙堑氖侄渭按覴缺昙窍虻ノ坏闾匾煨訮标记鏢、转化的进展。最后,对不同植物标记开发策略的选择及以上各种技术在功能标记开发中仁状翁岢鲇肦魑R糯ū昙枪菇ㄒ糯连锁图谱以来,分子标记技术及其应用研究日新月了分别以、癝为代表的三代分子标交为基础的标记技术,主要是。第二类是以从ξ;〉囊幌盗蟹肿颖昙羌际酰鏡檬菘庑蛄行畔⒑蜕镄畔⒀侄慰发新的分子标记随着表达序列标签苹氖凳┘八镜张征锋一肖本泽的应用前景作了展望。关键词标记开发,生物信息学,生物技术,功能标记錹分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的遗传标记形式。自从年异,相继出现了二十多种肿颖昙欠椒ǎ钩记。按其技术原理,可分为三大类:第一类是以分子杂、蚐等。第三类是以酶切和;础的分子标记技术,主要有和等近年来分子标记对植物遗传和育种研究的发展起到了革命性的作用,其应用涉及到重要性状基因或亩ㄎ弧⒁糯计椎墓菇ā⒅种首试匆传关系的确定、杂种优势群的划分、比较图谱分析、分子标记辅助选择及图位克隆等多个领域。本文重点介绍利用生物信息学及分子生物学手段开发分子标记的研究进展。分子植物育种,年,第恚期,,基金项目:本项目由国家自然科学基金资助V惺Ψ洞笱б糯ǖ骺赜胝仙镅Ш笔≈氐闶笛槭遥浜海华中农业大学植物科学与技术学院,武汉,。通讯作者。..;面甌.,,,.—‘
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掘方法燕要是基哂唷笔菘狻9手鼢叩暮怂⋯模式作物中基因及全长的克隆,大爨的等基因组测序工作的完成及其它一些重要生物基因组测序工作的相继开展为利用生物信息学手段开发分子标记提供了大量有益的信息。通过利用计算机程序,可以从置上存在转换、颠换、插入、缺失等变化T谝糯Х治鲋校琒作为一种遗传标记得以广泛应耀,主要源予这几个特点:芏裙剑遗传稳定性麓;子枞址治龅淖远c扑鑃的检测技术有多种,酒捎诰哂懈叨燃苫并行化、多样化、微型化等优点丽成为最理想的检测技拳心窑I镄湃П猄嚣数据库允许不同的机构在任意时间向数据库中提交存在多个拷贝,它们可能来源予阕一物种不同晶系、同种材料不同组织发育时期等,之间存在多态性。为陌莘⑻峁┝嗽娓坏淖试础H涨坝τ肊数据译区、┒诵蛄械确潜嗦胨淼男蛄惺欠⒕騍对非编码隧序列在鲈耘嘀种薪蠸分析,结蛄兄ъ喙逡桓鯯。鋈ǔ牟庑虿与基因组数据库粳稻的序列比对发现,由于⒉入缺失等廖歹多态性褥弓%的氨基酸承平替换。由于辩潆的特点,利用它可踱辛奄建出菲常耩细翡遗传图谱;在畁畁,甮菽χ校万的承稻驯欢ㄎ坏剿簋均匀覆盏整个基因缀等优点成为育种家秘遗传学┒恕⒒蚣湫蛄械确潜嗦胄蛄屑按覧等编鹨序甍中瑟发,蓠者称炎基因维哂懈鞯亩称为,来自转录本的特性赋予了其更高的价蓬:逶过溺源牲裣索溪以接断其功裁;霹瘸子对鑫然群体和种质收集的功能多样性分析;高水平的可转移性使之在比较定位和进化研究中可作为锚定标记。。鵖孓鼢鳃识别、