南海野生斑节对虾的线粒体16S rRNA基因序列单倍型分析.pdf.pdf

生态学杂志,:—
南海野生斑节对虾的线粒体基因
序列单倍型分析::
周发林江世贵姜永杰黄建华
中国水产科学研究院南海水产研究所,广州;。上海水产大学生命科学与技术学院,上海
摘要采用聚合酶链式反应技术对我国南海海域个地点三亚、深圳、阳江、湛
江、北海的野生斑节对虾个个体的序列进行扩增,扩增产物经纯化
后进行测序。用—排序软件对所得的个序列进行比对。通
过软件对所得个序列进行比较分析,共检测出个变
异位点,种单倍型。单倍型序列的碱基组成显示出较高的比例.% 。
种单倍型序列的遗传距离在.~.。根据构建的单倍型进化关系网,个地点群体
中的单倍型呈现一种混杂的分布格局。此外,根据单倍型在个地点群体出现的频率和单
倍型进化关系网,单倍型是最为原始的单倍型,其他种单倍型均起源于单倍型。
关键词;;斑节对虾;单倍型
中图分类号文献标识码文章编号——

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斑节对虾属于对虾科,对虾南方重要的对虾养殖种类。因为用于苗种生产的亲
属,广泛分布于西太平洋和印度洋沿岸的大部分地虾绝大多数来自于野生斑节对虾,过度的捕捞野生
区,我国的南海沿岸都有分布。这种虾具有生长快、斑节对虾可能使其野生种质资源受到影响。因此,
个体大、产量高、肉昧鲜美、营养丰富等优点,是我国管理、保护和合理利用我国南海海域的斑节对虾野
国家高技术研究发展计划项目、、生资源非常必要
广东省科技计划项目和农业结构调整重大技术研动物线粒体由于具有分子量小、结构简
究专项资助项目。.
通讯作者—:. 单、母性遗传、一级结构进化速度快等特征而作为一
收稿日期: 接受日期: 种优良的分子标记广泛应用于动物的群体遗传学和
生态学杂志第卷第期
系统进化研究刘亚军等,;张亮等,。其’一一’
中,在无脊椎动物种内的遗传变.,。扩增的反应总体积,
异研究中已经得到了广泛应用。例如,邱高峰等其中×,—
利用基因序列对野生和养· .,
殖中国明对虾群体的遗传.·一,·一弓物,
多样性进行了研究,发现被检测的模板,补足灭菌双蒸水至。扩增条件:
基因序列在群体之间存在一定的遗传分化。—℃预变性,之后进行个循环,
等对美菲对虾℃,,最后延伸。扩增产
基因序列进行了分析,发现个体问的物经.%琼脂糖凝胶电泳,胶回收纯化。纯化后
核苷酸碱基存在丰富的变异。此的产物送至测序公司英骏测序。
外,在虾夷扇贝. 数据分析
等,、栉孔扇贝刘亚军等, 用—程序对所获得的序列进行比对
、近江牡蛎苏天凤等, .,。用
和缢蛏牛东红等, .,统计软件分析序列单倍型的变异位点
群体的基因序列中,检测到和计算各单倍型的碱基组成。用软件—
了丰富的核苷酸变异位点。因此,本文通过对中国.,双参数法计算单倍型之间
南海海域的斑节对虾线粒体序列变的遗传距离和聚类分析。用软件构建
异分析,旨在了解我国南海海域野生斑节对虾遗传单倍型网络关系图。
分化