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Biolog ECO 步骤及数据分析方法.doc

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BiologECO步骤生态板(ECO)(示例)一鉴定步骤①土壤样品的采集,将土壤样品加入到灭菌水里接种。30min后,。②在10000r/min下离心20min,弃去上清液,加1mL生理盐水,在振荡器上振动5min使之混匀;再于10000r/min下离心20min,重复2次,除去其中的碳源;弃去上清液,加1mL生理盐水,在振荡器上振动5min使之混匀,于2000r/min下离心1min。③取上清液倒人装有20mL已灭菌生理盐水(NaC1,%)的试管中,±。④将上述稀释液加入BiologECO微平板中,(150µL/孔),然后在20℃下培养,每隔12h用Biolog细菌自动读数仪读取数据,连续测定10d。二数据处理方法(采用SAS,统计软件进行多样性指数差异显著分析和主成分分析)采用Biolog微平板培养120h的数据进行数据统计,采用Shannon指数、Shannon均匀度、Simpson指数、Mclniosh指数和Mclniosh均匀度各种多样性指数来反映细菌群落代谢功能的多样性。BiologECO平板反应一般采用每孔颜色平均变化率(AWCD)来描述。计算公式为:{AWCD=[Σ(Ci—R)]/31}。其中,Ci是除对照孔外各孔吸光度值,R是对照孔吸光度值。通过主成分分析(PCA)将Biolog生态板(ECO)平板的31种碳源的测定结果形成的描述细菌群落代谢特征的多元向量变换为互不相关的主元向量(PC1和PC2是主元向量的分量),在降维后的主元向量空间中可以用点的位置直观地反映出不同细菌群落的代谢特征。

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Biolog ECO 步骤及数据分析方法.doc

面板数据分析方法步骤

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Biolog方法与ECO板碳源

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