第三章生物信息学资源与数据挖掘工具.ppt

第三章生物信息学资源与数据挖掘工具一、国外重要生物信息中心NCBI美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation)前身是NIH所属的一个研究所的计算生物学研究室,1988年独立为NCBI,形式上属于国家医学图书馆(NationalLibraryofMedicine/NLM)管理着许多著名数据库,如GenBank、Medline、dbSNP、COG、OMIM等提供Entrez、(EuropeanBioinformaticsInstitute)1994年建于英国剑桥,前身是德国海德堡的欧洲分子生物学实验室的信息服务部门EBI接收了原来EMBL数据库的管理和维护是欧洲分子生物学网()的一个特别节点/(主页)/(工具)/(服务)NIG日本国立遗传学研究所(ics)创立于1949年7月1日,属文部省管辖信息服务始于1984年维护管理着DDBJ1987年1月发行DDBJ第一版他重要中心HHMI(HowardHughesMedicalInstitute)[美]MIPS(MunichInformationCenterforProteinSequences)[德]SIB(SwissInstituteofBioinformatics)[瑞士]SWISS-PROT,ExPASy,ENZYME,…NCGR[美],JIPID[日],HGMP[英],BioBase[丹],…二、数据库目录NAR数据库专辑从1994年开始,《核酸研究》杂志(NeucleicAcidsResearch)每年第一期是生物数据库专辑每个专辑大约介绍100多种库从2000年起,该杂志的出版社(牛津大学出版社)其他数据库列表NIH全球数据库列表./help/、常用序列格式