聚类分析图解.docx

?聚类分析服务修改时间2010-6-1613:50:40点击2126次目前,我们根据您的需要提供以下聚类分析服务::用挑选的差异基因的表达情况来计算样品直接的相关性。一般来说,同一类样品能通过聚类出现在同一个簇(cluster)中,聚在同一个簇的基因可能具有类似的生物学功能。要求:至少提供3组数据进行聚类分析。备注:双通道芯片产生的数据是Cy3通道和Cy5通道的荧光信号比值,即ratio值,Cy3通道信号和Cy5通道信号在常规实验设计中不能独立分开作为两组单通道信号值进行数据分析,因此,类似:肿瘤1vs癌旁1,肿瘤2vs癌旁2,肿瘤3vs癌旁3,这样的三次生物学重复双通道实验设计无法进行有意义的聚类分析。单因素聚类图,聚类图下方的红绿色阶表示基因表达量的从高(红色)到低(绿色):按照一个固定的顺序对若干个样品进行SOM聚类分析,寻找在四个组织内表达模式类似的基因群。要求:具有序列实验设计样品的实验数据。备注:双通道芯片产生的数据是Cy3通道和Cy5通道的荧光信号比值,ratio值,Cy3通道信号和Cy5通道信号在常规实验设计中不能独立分开作为两组单通道信号值进行数据分析。自组织映射聚类SOM结果图。每个趋势用蓝色的折线表示。每个趋势可以通过一个六边形同另外一个趋势连接。六边形的灰度表示相关性系数(correlation)的大小,白色:correlation=1,黑色:correlation=0,灰度表示不同的相关性系数。通过连接相邻两个趋势的六边形的灰度可以了解它们之间的相关性系数。自组织聚类SOM趋势图,每个小图表示一种表达趋势,(PCA)目的:考察样品的分布情况,验证实验设计的合理性,生物学重复样品的均一性。要求:至少2组数据。备注:双通道芯片产生的数据是Cy3通道和Cy5通道的荧光信号比值,ratio值,Cy3通道信号和Cy5通道信号在常规实验