基因本体论(Gene Ontology)概览课件.ppt

基因本体论(Gene_Ontology)概览课件基因本体论(GeneOntology)概览报告:孔垂亮导师:高琳日期:10/09/27DesignedbyMorrain1为什么要建立GeneOntology解决生物学定义混乱的现象,使各种数据库中基因产物功能描述相一致使得在不同生物数据库中的查询具有极高的一致性允许在各种水平查询基因产物的特性2GeneOntologywidelyadoptedAgBase3GO(geneontology)是:基因本体联合会(GeneOnotologyConsortium)所建立的数据库,旨在建立一套适用于各种物种的,对基因和蛋白质功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语义(terms)词汇标准。4GO语义的分类分子功能(MolecularFunction)描述在个体分子生物学上的活性,如催化活性或结合活性。生物学过程(BiologicalProcess)由分子功能有序地组成的,具有多个步骤的一个过程。细胞组件(ponent)指基因产物位于何种细胞器或基因产物组中(如糙面内质网,核糖体,蛋白酶体等),即基因产物在什么地方起作用。56语义信息id:GO:0043473name:pigmentationnamespace:biological_processdef:"anism,tissueorcell."[GOC:krc]synonym:Noneis_a:GO:000815078语义之间的关系isa、partof(细胞质)(细胞器)(线粒体)(细胞器膜)9语义关系之间的推导isa·isa→isapartof·partof→partof10