跨膜区分析(TMHMM)跨膜区分析(TMHMM)蛋白质含有跨膜区,提示它可能作为膜受体起作用,也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。。TMHMM是一个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序,它综合了跨膜区疏水性、电荷偏倚、螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质,可对跨膜区及膜内外区进行整体预测。由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长,故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白。SIB2步骤一:打开在线工具,步骤二:提交序列步骤三:参数设置参数介绍:Extensive,withgraphics(图形化显示)Extensive,nographics(不以图形化显示)Onelineperprotein(每个蛋白遵行显示)步骤四:显示结果结果解读结果显示:P8蛋白的1--405位氨基酸位于细胞膜表面,406--426位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区。
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