ICR转座子家族的发现及分析.pdf

Secrecy: No. Chinese Academy ofAgricultural Sciences Dissertation The Construction ic Map ofGossypium Herbaceum Chromosome 1&The Discovery and Analysis ICR Transposable Element Family :Cui Xinglei Supervisor: Kunbo Maj or:Crop Germplasm Resource Specialty:Evaluation and Germplasm Innovation June 2015 万方数据独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:橇矗街’时问:"Lo/5"年g-月多夕日关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定,即:中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名: 导师签名: .橇相时间:1。7r岁年夕月岁。日时间:1声c,孓年;只万方数据中国农业科学院硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目草棉1号染色体物理图谱的构建及CICR转座子家族的发现与分析鉴定评价与种论文作者崔兴雷专业作物种质资源研究方向质创新指导教师王坤波培养单位(研究所) 棉花所硕(博) 姓名职称单位专业签名导师评硕导口\\ 孔令让教授博导西山东农业大学作物遗传育种阅硕导口中国农业科学\\ 人姜慧芳研究员博导西院油料作物研作物种质资源学篡辩硕导口粉-确主聂以春教授华中农业大学作物遗传育种席博导臼硕导口> 郭小平教授华中农业大学作物遗传育种绷卜勿博导洒硕导口雌、L 华金平教授中国农业大学作物遗传育种博导留蓉南形硕导口/ 中国农业科学作物遗传育种宋国立研究员博导d 院棉花研究所辨硕导口中国农业科学锄去等毛树春研究员作物栽培与耕作学委博导口院棉花研究所硕导口博导口贝硕导口博导口硕导口博导口会议记录(秘书) 万方数据摘要荧光原位杂交是一种利用碱基互补配对原则,可以在染色体、间期细胞核和DNA纤维上进行特定DNA序列精确物理定位的技术。随着该技术的不断改进和完善,如今被广泛地应用在染色体的识别与鉴定、物理图谱的构建、基因定位、基因组亲源性分析等研究上。本实验通过荧光原位杂交技术构建了草棉l号染色体的物理图谱,ICR 是一个转座子家族(family),属于矽3一Gypsy超家族(super-family),%,在D基因组棉种整个序列中所占的比例几乎为零。这些结果对构建草棉1号染色体图谱以及棉属的进化研究有重要的作用。主要内容如下: ,用其筛选海岛棉Pima 90—53BAC文库,得到了47个阳性BAC克隆。用这些阳性克隆作探针,草棉的有丝分裂中期染色体为靶DNA,经过荧光原位杂交,从中鉴定出有清晰荧光杂交信号的BAC克隆10个。通过测量杂交信号在多个伸展较好的染色体上的相对距离,确定了每个BAC克隆在草棉1号染色体上的位置,构建了草棉1号染色体含有10个对应SSR分子标记的物理图谱。 。发现大部分共有分子标记的顺序在两类图谱中是相同的,其中3个分子标记在顺序上有差别, 表示草棉在进化过程中1号染色体可能发生了局部的倒位易位。 (Relative Map Position)单位,对草棉1号染色体物理图谱与4个棉花1 号染色体的遗传连锁图谱上共有分子标记的位置关系进行了比较。发现大部分分子标记的位置信息在不同图谱中是有差异的。原因可能是遗传图谱的构建是由交换率得出的,而染色体不同位置的交换率是不同的,因此分子标记在遗传图谱中的位置可能不是其在染色体上的真实位置。 ,对D基因组的雷蒙德氏棉有丝分裂中期染色体进行荧光原位杂交。发现其中的两个BAC克隆305A19和216815在雷蒙德氏棉1号染色体上显示出清晰的荧