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标准的PCR反应体系.docx


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文档列表 文档介绍
标准的 PCR反应体系
PCR反应体系与反应条件
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标准的

PCR反应体系:
10×扩增缓冲液

10ul
4 种

dNTP混合物

各 200umolL
引物

各 10~ 100mol
模板

DNA

01~2ug
TqDNA聚合酶 25u
g2+ 15mmolL
加双或三蒸水至 100ul
PCR反应五要素:参加 PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、 dNTP、模板和 g2+
引物:引物是 PCR特异性反应的关键, PCR产物的特异性取决于引物与模板 DNA互补的程度。 理论上, 只要知道任何一段模板 DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引
物,利用 PCR就可将模板 DNA在体外大量扩增。
设计引物应遵循以下原则:
①引物长度:

15-30b ,常用为

20b 左右。
②引物扩增跨度:以

200-500b

为宜,特定条件下可扩增长至

10kb

的片段。
③引物碱基: G+C含量以 40-60%为宜, G+C太少扩增效果不佳, G+C过多易出现非特异条带。 ATGC最好随机分布,避免 5 个以上的嘌呤或嘧啶 核苷酸的成串排列。
④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是

3'

端的互补,否则会形
成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。
⑤引物 3' 端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致 PCR失败。
⑥引物中有或能加上合适的酶切位点, 被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点, 这对酶切分析或分子克隆很有好处。
⑦引物的特异性: 引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。 引物量: 每条引物的浓度 01~ 1umol 或 10~100mol ,以最低引物 量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。
酶及其浓度 目前有两种 TqDNA聚合酶供应, 一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然
酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。催化一典型的 PCR反应约需酶量 2。 5U( 指总反应
体积为 100ul 时 ) ,浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。
dNTP的质量与浓度 dNTP的质量与浓度和 PCR扩增效率有密切关系, dNTP粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性。 dNTP 溶液呈酸性,使用时应配成高浓度后,以
1NH或 1Tris 。 HCL的缓冲液将其 PH调节到 70~75,小量分装, - 20℃冰冻保存。多次冻融会使 dNTP降解。在 PCR反应中, dNTP应为 50~ 200umolL ,尤其是注意 4 种 dNTP的浓度要
相等 ( 等摩尔配制 ) ,如其中任何一种浓度不同于其它几种时 ( 偏高或偏低 ) ,就会引起错配。
浓度过低又会降低 PCR产物的产量。 dNTP能与 g2+结合,使游离的 g2+浓度降低。
模板 ( 靶基因 ) 核酸 模板核酸的量与纯化程度,是 PCR成败与否的关键环节之一,传统的 DNA纯化方法通常采用 SDS和蛋白酶 K 来消化处理标本。 SDS的主要功能是:溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白, SDS还能与蛋白质
结合而沉淀; 蛋白酶 K 能水解消化蛋白质, 特别是与 DNA结合的组蛋白, 再用有机溶剂
酚与***仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份, 用乙醇或异丙醇沉淀核酸。 提取的核酸即可作为模板用于 PCR反应。一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化
除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接用于 PCR扩增。 RNA模板提取一般采用异硫***酸胍或蛋白酶 K 法,
要防止 RNse降解 RNA。
g2+浓度 g2+对 PCR扩增的特异性和产量有显著的影响, 在一般的 PCR反应中, 各
dNTP浓度为 200umolL 时,g2+浓度为 15~ 20m

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