2020年比较基因组学与分子进化1.ppt

必要性
可行性
应用性
课程特色
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比较基因组学与分子进化1
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本课程开设的必要性
大量模式生物测序工作的完成
2. 公共资源数据体系的大规模建立
(NCBI, USA; EMBL, European; DDBJ,Japan)
，如何从这些数据中获得自己想要的知识，
搜集、管理、处理、分析、释读能力的要求迅速提升，
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比较基因组学与分子进化1
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模式生物 (model organism)
生物学家通过对选定的生物物种进行科学研究，用于揭示某种具有普遍规律的生命现象，此时，这种被选定的生物物种就是模式生物。比如，孟德尔在揭示生物界遗传规律时选用豌豆作为实验材料，而摩根选用果蝇作为实验材料，在他们的研究中，豌豆和果蝇就是研究生物体遗传规律的模式生物。
由于进化的原因，许多生命活动的基本方式在地球上的各种生物物种中是保守的，这是模式生物研究策略能够成功的基本基础。
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比较基因组学与分子进化1
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模式生物
基本共同点：
，能够代表生物界的某一大类群； 
　　，容易获得并易于在实验室内饲养和繁殖；
　　、子代多、遗传背景清楚；
　　，特别是具有遗传操作的手段和表型分析的方法
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比较基因组学与分子进化1
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比较基因组学与分子进化1
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Genome project
Resourse number status model
Microbial genomes 347 complete
Fungal genome 83 in progress, complete S. cerevisiae, mushrooms
Viral genome 1044 in progress, complete AIDS, SARS
Parasitic genome >38 in progress, complete Brugia malayi, Heterodera glycines
Insect genome 44 in progress , complete Drosophila melanogaster, beetle, bee
Plants 34 in progress, complete Arabidopsis thaliana, rice, soybean, maize
Mammals 43 in progress, complete Human, mouse, rat, cow, dog, chimpanzee
Other animals 84 in progress, complete , zebrafish, chicken,
Data from NCBI and TIGR database
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比较基因组学与分子进化1
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Number of Genes in
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比较基因组学与分子进化1
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Genome Res. 17:1675-1689, 2007
狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”
全球第一张白种人基因组图谱, 7月由美国科学家公布 .
中国人基因组图谱(又称“炎黄一号”)，
第一个亚洲人全基因序列图谱, ,
Released Genome Projects, 2007