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畜禽基因定位方法及研究
 
 
基因定位是指准确的确定控制表型性状的基因在基因组上的位置，包括确定基因在连锁群上相对位置的遗传定位和确定基因在染色体上具体位置的物理定位。对基因的识别与定位将使人们对单个基因的作用及其与其它基因的互作加深了解，从而建立更适合反映性状变异的统计模型，找到基因与各种性状间的相关关系，以更有效地估计育种值并在远期控制动物疾病。早在1923年SAX就成功地利用了遗传标记进行数量性状基因位点定位试验，但长期以来由于缺乏合适的遗传标记．使这些研究没有重大的进展。自从微卫星等各种遗传标记的出现及其测定方法的不断改进，特别是人类基因组计划的启动，使得基因定位研究发展十分迅速翻。畜禽基因定位计划于20世纪90年代初开始实施，其主要目标是要找到重要经济性状座位或与之连锁的DNA标记，并将其用于标记辅助选择来改良畜禽品种，提高畜禽生产效率和经济效益。
1  遗传图谱的构建
    基因的精确定位首先依赖于遗传图谱(genetic map)。遗传图谱又称为遗传连锁图谱(genetic linkage map)，是利用多态性遗传标记，通过对参考家系进行遗传连锁分析得到的，反映了遗传标记之间的相对关系。遗传图谱的质量取决于连锁群中的遗传标记的数量、杂合度和均匀分布的程度，遗传标记之间的距离用分摩尔根(eM)表示。从理论上讲，任何一个可观察性状的基因座位都可以在连锁遗传图谱中找到一个与之相连锁的DNA标记。因此。分析畜禽经济性状座位(通常是数量性状座位，QTL)在基因组的位置以及对表型性状的影响，主要都是依赖于遗传连锁图谱。构建遗传图谱的程序大致包括：建立参考家系(reference famiIv)；对参考家系的每一成员组作遗传标记的基因型分析：进行标记间的连锁分析，得出连锁群；绘制遗传图谱。
畜禽遗传图谱的研究始于20世纪80年代末期，进入上世纪90年代以来，美、欧、日等发达国家先后启动了动物基因组研究计划。纷纷投入巨资和庞大的科研力量进行研究。短短10余年的时间，在猪、牛、绵羊、鸡等主要畜禽上取得了巨大的进展。随着动物基因组研究计划的深入开展，各种畜禽更加完善的遗传图谱将陆续被构建出来。
2物理图谱的构建即基因的精确定位
物理图谱的研究旨在将被克隆基因或DNA标记精确的定位于染色体上．对于研究物种进化和位置克隆经济性状基因有着十分重要的作用。基因的物理定位方法通常有体细胞杂交法、荧光原位杂交法、引物原位标记法、系列对比法等。
2．1  体细胞杂交法
在已定位的全部基因中，约有40％的基因是用这一方法定位的。此法可进行基因同线性测定(synteny test）及区域定位。其基本条件是要获得核型相对稳定一致的体细胞杂种克隆，即由若干杂种细胞构成的一套杂种细胞克隆(如猪／鼠)，每个细胞克隆都包含各自不同的染色体组合模式，构建克隆棋盘fclone panel)。研究者把各杂种细胞克隆及所含染色体都列在一个表上。若要对某特定表型对应的基因定位．就可取出这些细胞克隆材料，分析有无有关产物，再与克隆棋盘所列染色体对照，即可确定基因所在染色体。如果要进行基因的区域定位，则必然有一套含有特定染色体结构变异或保留特定染色体片段的克隆棋盘。
    利用体细胞杂交法定位猪基因的典型例子是MPI （甘露糖磷酸异构酶)和NP(核苷磷酸化