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基因组测序和用Illumina公司测序技术分析中国仓鼠卵巢细胞系
Genomic sequencing and analysis of a Chinese hamster ovary cell line using Illumina sequencing technology
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背景
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背景
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在真核细胞中国仓鼠卵巢(CHO)细胞是目前重组糖基蛋白生产的首选体系。它是用来表达外源蛋白最多也最成功的一类细胞。然而一些基因资源可以帮助工程高生产细胞株。
结果
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可用Illumina公司高通量测序技术来测中国仓鼠的基因，与模式生物老鼠基因的进行比较，也可通过高通量测序技术可以发现一些新的强启动子，寻找合适的增强子，装配适合于cDNA 高效表达的必要元件以及根据CHO 细胞翻译特点调整外源基因密码子等，大多数的这些基因参与代谢过程,细胞信号及转运等。
结论
这展示了新一代测序技术的适用性，并且提高表达水平，在进一步提高表达水平的同时。还将注重分离纯化的问题，如改变DNA中的个别序列，使表达产物在不影响生物，活性的前提下，携带有利于分离纯化的基团。
一、中国仓鼠(Hamster /Mouse)与模式生物老鼠(Rat)的比较
Figure 1: 仓鼠与老鼠的参考基因组
Figure 2：短序列的基因覆盖率
Figure 3：中国仓鼠卵巢细胞的基因重叠群
Figure 4：BLAST分析法定义基因的不同功能

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基因基因组和基因组学

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基因、基因组和基因组学

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基因、基因组与基因组学