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2021年跨膜区分析专题教育课件讲义.ppt

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跨膜区分析(TMHMM）
蛋白质含有跨膜区，提示它可能作为膜受体起作用，也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。
。TMHMM是一个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序，它综合了跨膜区疏水性、电荷偏倚、螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质，可对跨膜区及膜内外区进行整体预测。由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长，故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白。
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SIB
跨膜区分析专题教育课件
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步骤一：打开在线工具，-/
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步骤二：提交序列
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步骤三：参数设置
参数介绍：
Extensive, with graphics（图形化显示）
Extensive, no graphics （不以图形化显示）
One line per protein（每个蛋白遵行显示）
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跨膜区分析专题教育课件
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步骤四：显示结果
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结果解读
结果显示：
P8蛋白的1--405位氨基酸位于细胞膜表面，406--426位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区。
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跨膜区分析专题教育课件
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结果显示：
与该蛋白的疏水性区域分析结果基本一致，表明P8蛋白可能是一个与细胞信号传导有关的膜受体蛋白。
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跨膜区分析专题教育课件
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