生 物 信 息 学Bioinformatics第2讲 生物信息学研究内容
主讲教师: 刘 吉 平
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2004年3月
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生 物 信 息 学
主要介绍的内容:
什么是生物信息学?
国内外生物信息学的研究历史和现状。
生物信息学的研究内容和科学目标。
分别解读生物分子的三大核心数据库:GenBank核酸序列数据库、SWISS-PORT 蛋白质序列数据库、 PDF生物大分子结构数据库。
介绍国内外有关生物信息学的网站和网址。
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生物信息学
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Biology
Protein
Phenotype
DNA
(Genotype)
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基因结构
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The 4 bases
c
N
N
C
C
C
C
C
C
C
C
C
N
N
N
N
N
H
o
o
H
H
H
H
H
H
H
H
Adenine
Thymine
c
N
N
C
C
C
C
C
C
C
C
N
N
N
N
H
o
H
H
o
N
N
H
H
H
H
H
Guanine
Cytosine
A-T
G-C
Note: this is flat!
Uracil replaces T
in RNA
Purine ring
Pyrimidine ring
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三 研究内容
生物信息学与计算生物学或生物计算有着密切的关系,但又不尽相同.
目前归入生物信息学研究领域的大致有以下七个方面:
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Bioinfomatics七个方面研究内容
建立和管理各种生物数据库
生物信息数据库使用
生物信息学中的数学模式和算法研究
数据库接口和检索工具的研制
HGP的实施,对信息采集和处理提出的要求
生物信息学最重要的任务,是从大量数据中提取新知识
DNA芯片和微阵列的发展
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1 建立和管理各种生物数据库
各种生物数据库的建立和管理。如核酸序列数据库、蛋白质数据库、各种专业的数据库等。
这是一切生物信息学工作的基础,通常要有计算机科学背景的专业人员与生物学家密切合作。
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2、生物信息数据库使用
近些年来随着快速序列测定、基因重组、多维核磁共振等技术的应用,基因组与蛋白质的实验数据呈爆炸性趋势增长;
建立数据库再结合有关的分析软件使大规模数据的贮存、处理和分析成为可能,并已发展成为包括基因组信息与蛋白质结构模拟在内的生物信息学研究的重要基础。
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