生物信息学技术
Technology of Bioinformatics
生物信息学是一门综合运用生物学、计算机科学和数学等多方面知识与方法,获取、管理、分析、解释和应用生物信息的学科。
什么是生物信息学
概要
数据库及其查询
序列比对
引物设计
预测启动子和转录因子
预测开放阅读框
蛋白质数据分析
(biological imformation)
生物信息
2. 生物信息学的发展史
20世纪60年代 —— 最早的蛋白质数据库
Margaret Dayhoff
<<蛋白质序列与结构图谱>>
“蛋白质信息资源”(Protein Information Resource, PIR)
R. Dulbecco
A turning point in cancer research: sequencing the human genome
Science 7;231(4742): 1055-6
“要彻底阐明癌症的发生、演进、侵袭和转移的机制, 必须对人体细胞的基因组进行全测序.”
1990年10月, 美国政府正式启动一项耗资30亿美元的15年计划---人类基因组计划 (Human Genome Project, HGP).
20世纪80年代 —— 人类基因组计划
“今天,我们知道了上帝用以创造生命的语言。”
堆积如山的数据……
“对于上帝带来的这份神圣礼物中所展现的复杂、精致和奇妙,我们怀有更多的敬畏之情。”
3. 生物学数据库
核酸序列数据库
GenBank
EMBL
DDBJ
蛋白质序列数据库
PIR
SWISS-PROT
蛋白质结构数据库
PDB
重要的一级数据库
国际核酸序列数据库联合中心 (International Nucleotide Sequence Database Collaboration)
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