dnastar使用说明.doc

1 DNAstar 中文使用说明书目录 DNAStar 的安装与升级……………………………………………….….6 EditSeq 的使用方法……………………………………………………….7 打开已有序列寻找开放读框 DNA 序列翻译遗传密码选择使用遗传密码修改序列的反向互补及反向转换 BLAST 检索序列信息查看序列校读序列的保存与输出 GeneQuest 的使用方法…………………………………………………… 12 打开已有分析文件 GeneQuest 的DNA 分析方法用分析方法操作方法参数改变结果展示优化 Feature 注释 BLAST 检索 Entrez Database 检索 GeneQuest 的其他特点保存分析文件 2 MapDraw 的使用方法……………………………………………………… 18 新酶切图制作过泸器类型应用频率过泸器应用手动过泸器使用过泸器一览表使用 Must Cut Here/Don ’tCut Here 调色板工具酶信息显示环形展示 ORF 图显示择选保存,退出 MegAlign 的使用方法…………………………………………………….23 创建队列文件序列设置 Pairwise Alignment 使用 Dot Plot Method 多序列比较 ic Tree 查看查看队列报告 Decorations/Consensi MegAlign 文件保存 PrimerSelect 的使用方法……………………….….………………….28 创建 PrimerSelect 文件定义引物特点查找引物对浏览其他的引物信息按特征对引物分类引物长度改变在引物中引入突变设计新引物使用寡核苷酸订购表格保存 PrimerSelect 文件 Protean 的使用方法…………………………………………..………… 34 创建蛋白质分析文件 Protean ’s蛋白质分析方法应用分析方法方法参数改变优化结果显示使用蛋白酶消化与 SDS PAGE Feature 注释 BLAST 检索二级结构模拟展示滴定曲线 3 保存分析文件 SeqManII 的使用方法………………………………………….………… 39 输入序列片段 Pre-Assembly Options 操作检查修整的数据序列装配查看范围和构建结果去除矛盾碱基和缺口手动修改序列末端文件保存与序列输出 4 DNAStar 的安装与升级如果您以前已经安装了 Lasergene 而且目前有升级和服务联系,您就可以通过英特网来升级您现有的版本,各种模块(module )都是以自解压形式存储的,你可以选择性的下载安装。必备条件您的用户名和会员号是必需的,可以在安装盘上找到。程序升级备份您已有的 Lasergene ,找到您要升级的执行程序,并把它转移到备份的文件夹中。连接到 DNAstar 网站的主页( ),从菜单中的 Customers 中点击 Lasergene Updates 点,安提示输入密码和用户名(与会员名相同),这样就会打开下载页面。找到 windows 软件( Windows 95/98/NT Software .),就可以下载您想要的模块了。模块下载完毕以后,双击文件将其解压缩完毕。看到“Application name ”has been updated .说明升级完毕。软件安装本节介绍若何从 CD在PC机(Windows )上安装 Lasergene 。注意安装是尽量关闭所有其它程序以保证安装顺利进行。必备条件一张个人的 Lasergene 安装盘; 一张 Lasergene 软件光碟; 足够的硬盘空间和内存:至少 30Mb的硬盘, 32Mb的RAM 。从光盘安装 Lasergene 插入安装盘和安装光盘,双击安装图标,则出现下面的窗口,点击继续则出现安装窗口。随后一次出现下面窗口,请按照提示做出选择然后点击 Next ,直至完成安装。 EditSeq 的使用方法 EditSeq 是能够迅速、正确地输入,并且修改 DNA 或蛋白质序列工具。每个 EditSeq 文件都可以分为三个可编辑的部分,上边的一部分为序列文件,中间的 5 一部分里是评论,底部是序列的注释。 EditSeq 能读取大部分的序列格式——包括 FASTA ,GenBank ,ABI 、GCG 和 ASCII 格式。你可以使用菜单命令或拖拽方式输入序列文件。另外, 序列也许通过使用键盘输入,或者从其他地方复制、粘贴得到。经 Entrez 或BLAST 检索得到的序列可以直接从因特网或企业内部互联网服务器下载。序列被打开后,EditSeq 能使用标准或者指定的遗传密码进行翻译,或者反翻译,寻找开放读框,还可以进行阅读校对。另外,EditSeq 能以 GenBank ,FAST A 和GCG 格式输出序列。