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牛樟芝zn(ⅱ)2cys6转录因子的全基因组鉴定与分析.pdf


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森林与环境学报2021, 41(2) : 157-163 第41卷第2期
Journal of Forest and Environment 2021年3月
DOI : .
牛樟芝Zn( n )2Cys6转录因子
的全基因组鉴定与分析
罗玛妮娅",王 毅2,3,郑 元「, 张 璋",王 娟4,杨宇明4
( , 云南昆明650224; , 云南昆明650201;
, 云南昆明650201;
, 云南昆明650233)
摘要:为深入了解牛樟芝Zn( n)2Cys6转录因子的功能, 利用本地Blast对牛樟芝全基因组的蛋白序列
进行全局比对, 鉴定出20个牛樟芝Zn( n)2Cys6转录因子蛋白序列。通过生物信息学方法对
Zn( n)2Cys6转录因子进行结构和功能预测, 并利用转录组测序分析Zn(H)2Cys6转录因子在不同段木
培养条件下菌丝体和子实体的表达情况。结果表明: 20个Zn( n)2Cys6转录因子均具有Cy6型锌指基
开放科学标识码
序, 属于GAL4型锌簇蛋白转录因子, 其氨基酸数量为225~ 1 384个; ,
(OSID 码)
均为不稳定蛋白; 其中, AcCys6-17存在跨膜结构; AcCys6-9、AcCys6-14定位在细胞质中; 平均每个
转录因子含9个外显子,

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  • 时间2021-07-05