freeroi 在功能磁共振roi分析中的应用(PPT).ppt

freeroi 在功能磁共振roi分析中的应用(PPT).ppt在应用ROI分析的研究中，ROI的确定方式主要有以下几种
根据解剖图谱确定ROI
根据功能激活区确定ROI
以确定坐标点为中心生成规则ROI
前言
打开一个terminal
输入freeroi，键入回车，开启程序
点击File -> Open standard volume，打开一个结构像
FreeROI使用方法
FreeROI使用方法
图像区：以不同的形式呈现图像
在不同的图像显示形式间切换
导入新volume；
删除已载入的volume；
新建空白volume；
保存volume数据到文件；
FreeROI使用方法
改变volume的排列顺序；设置激活值阈限；设置volume显示颜色；显示当前鼠标选择点坐标
由脑结构图谱生成ROI
载入文件，显示颜色为rainbow。
假设我们想针对特定脑区开展研究
选中Harvard Oxford模板
点击工具栏ROI toolset一项，弹出对话框
根据需要选择脑区，提取ROI
由脑结构模板生成ROI
基于当前的研究结果，我们还没有准确的找到大脑功能区和结构脑区之间的对应关系。
同时，结构脑区的划分程度相对较粗，一个结构脑区中可能同时包含多个功能脑区。
以上问题要求我们，要想获得更加精细的功能脑区，就需要根据功能激活图，选取ROI。
ROI的功能一致性
利用FSL选取FFA
通过手画ROI的操作，我们会发现过程中主要有两个问题
画笔的大小不容易选取，很难准确的只把激活区画上；
如果要画多个ROI，我们需要自己记住各个ROI的编号，画ROI时容易用错标记值。
如何改进当前的工作流程
基于激活图手画ROI