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跟着ncbi数据库各样资源的浮现， NCBI已经成为科研
工作NCBI数据库资源
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列比对(Alignments)”等部分页面都能够睁开和收起。别的，
网页上还供应了“结果输出格式选项 (Formatting)”和“结果
下载选项(download)”，在下载选项中还新增了 CSV格式下
载。这样，读者能够轻松地将 BLAST的比对结果输入到表
格办理软件中去。此外， BLAST比对结果页面上的
“Alignments”部分还供应了每一条命中序列在 EntrezGENE
中的有关信息，这些信息包含基因名称、根源物种以及在PubMed数据库中与该基因有关条目的数目等。
“BLASTtree”结果输出模式能够丈量不一样序列间的距
离，自动收起亚类信息等。此刻，能够以Newick格式或Nexus
格式下载 BLASTtree结果，也能够在进化树图中选择任一
节点从头构树。最后还要向读者介绍 ncbiblast的一个新网
址：URL:。NCBI建议读者都使用这个网址登岸NCBIBLAST，因为该BLAST使用更多的计算机进行剖析，也拥有更强的系统容错能力。
EntrezGene改良及更新
基因组说明工作中间有一项重要的工作就是定位基因重
叠群序列(contigsequences)，即在染色体中找出某个基因的
定位。实质上基因组测序工作就是将很多基因重叠序列相互
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拼接，最后拼出“完好 (中间会有一些空隙 )”的基因组图谱。
这项工作能够直接将某个基因与某段基因重叠群序列对应
起来，但不可以直接将该基因与染色体联系起来，而这恰好是
生物学家最感兴趣的地方。所以，为了能让用户在搜寻基因
的同时，也能认识到一些该基因在染色体中的定位状况，
EntrezGene推出了新的“Limits”服务，用户能够使用该服
务在基因组范围内进行基因搜寻。用户能够在某个物种染色
体的某个地区里进行基因搜寻。
EntrezGene会按以下三种次序对搜寻出的基因进行排序：
依据基因名排序。
依据有关性排序，即依据结果与用户搜寻所使用的重点词，比如基因名称等的般配程度排序。
依据基因重要性排序，即依据该基因在PubMed、
Homologene、ProteinClusters、OnlineMendelianInheritanceinMan(OMIM)或Bookshelf中文件数目的多少进行排序。
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2ENTREZ 搜寻系统
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Entrez
Entrez数据库是一个整合了多个数据库的综合检索系统，
它包含了35个不一样数据库的信息，共收录有超出 350,000,000
条记录(表1)。Entrez数据库支持使用简单的布尔查问
(Booleanqueries)方式进行文本搜寻， 能够下载不一样格式的数
据资料，还可以够依据生物学关系供应与其余有关记录的链
接。这些链接给出的都是最简要的信息，比如会给出一条序
列和报导该序列的论文纲要，或许会给出一条蛋白质序列的
编码DNA序列或该蛋白质的 3D构造图。这类经过计算机运
算，即鉴于比较序列相像性或 PubMed中纲要的相像性，所
给出的有关链接信息能够以最快的速度供应给用户大量的
有关信息。还有一种叫做“LinkOut”的功能将这类链接功能
扩展到了与外面数据库，比如各物种基因组数据库之间的链
接。Entrez中搜寻到的数据能够以多种格式输出，也能够打
包下载或逐一下载。
MyNCBI
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MyNCBI 功能是为了方便用户储藏个人配置信息， 比如搜寻
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