优选染色质结构与基因转录
第一页,共十六页。
染色质结构与基因活化
活性染色质及其主要特征
染色质结构与基因转录
一
二
第二页,共十六页。
真核生物内DNA是裸露的吗?
优选染色质结构与基因转录
第一页,共十六页。
染色质结构与基因活化
活性染色质及其主要特征
染色质结构与基因转录
一
二
第二页,共十六页。
真核生物内DNA是裸露的吗?
染色质
核酸
蛋白质
少量RNA
DNA
组蛋白
非组蛋白
核小体
阻断了转录的进行
第三页,共十六页。
一、活性染色质及其主要特征
活性染色质(active chromatin)与
非活性染色质(inactive chromatin)
活性染色质的主要特征
(一)
(二)
第四页,共十六页。
活性染色质:具有转录活性的染色质
非活性染色质:没有转录活性的染色质
活性染色质的核小体发生构象改变,具
有疏松的染色质结构,从而便于转录调
控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合
酶在转录模板上滑动。
(一)活性染色质(active chromatin)与 非活性染色质(inactive chromatin)
第五页,共十六页。
Ⅰ.活性染色质具有DNase I超敏感位点(DNase I hypersensitive site,DHS):
活性染色质对DNase具有优先敏感性。
超敏感位点是一段长100~200bp的DNA序列特异暴露的染色质区域。
大部分位于5‘-端启动子区。可能是为RNA聚合酶、转录因子或其他蛋白调控因子提供结合位点。
(二)活性染色质的主要特征
第六页,共十六页。
Ⅱ. 活性染色质在生化上具有特殊性
活性染色质很少有组蛋白H1与其结合;
活性染色质的组蛋白乙酰化程度高;
活性染色质的核小体组蛋白H2B很少被磷酸化
活性染色质中核小体组蛋白H2A在许多物种很少有变异形式;
HMG14和HMG17只存在于活性染色质中。
(二)活性染色质的主要特征
第七页,共十六页。
Ⅲ .活性染色质在组蛋白修饰上的特异性
***化、乙酰化(标志)、磷酸化
(二)活性染色质的主要特征
第八页,共十六页。
Questions:
如何形成活性染色质中的超敏感结构?
如何隔离活性区域与非活性区域?
RNA聚合酶如何通过与组蛋白结合的DNA模板进行转录?
第九页,共十六页。
二、染色质结构与基因激活
(一)
(二)
(三)
疏松染色质结构的形成
染色质的区间性
染色质模板的转录
第十页,共十六页。
Ⅰ. DNA局部结构的改变与核小体相位的影响
当调控蛋白与染色质DNA的特定位点结合时, 染色质易被引发二级结构的改变;进而引起其它的一些结合位点与调控蛋白的结合。
核小体变构因子可通过改变核小体的相位协助基因转录
疏松染色质结构的形成
(一)
第十一页,共十六页。
核小体易位使得转录因子能与DNA结合:
有些细胞具有某些“工具”(如人类细胞的SWI/SNF复合物)能撬开被核小体阻断的DNA区域,从而允许转录因子与DNA接触。
第十二页,共十六页。
Ⅱ. 组蛋白的修饰:影响转录活性
——决定了染色质处于活性或非活性状态。
直接影响:改变染色质的结构(如:磷酸化)
间接影响:使核小体变构(易位/解体等),使其他调控蛋白易于和染色质相互接触
例如:组蛋白的赖氨酸残基的乙酰化
Ⅲ. HMG结构域蛋白
HMG结构域可识别某些异型的DNA结构,与DNA弯折和DNA-蛋白质复合体高级结构的形成有关。
(一)
疏松染色质结构的形成
第十三页,共十六页。
(二)染色质的区间性
基因座控制区(locus control region,LCR)
染色体DNA上一种顺式作用元件,具有稳定
染色质疏松结构的功能;
与多种反式因子的结合序列可保证DNA复制
时与启动子结合的因子仍保持在原位。
隔离子(insulator)
概念:处于抑制状态与活化状态的染色质结构域之间、能防止不同状态的染色质结构特征向两侧扩展的染色质 DNA序列。
作用:作为异染色质定向形成的起始位点;
提供拓扑隔离区;涉及追踪机制。
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