常见酶切位点与保护碱基.docx

不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求 不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求
酶
真核甘酌序列
切割率%
交Fl左口 14只，J 7 U
2hr
20hr
AccI
GGTCGAC C
o
0
ATTC C
>90
>90
CG GAATTC CG
>90
>90
CCG GAATTC CGG
>90
>90
Haelll
GGGGCC CC
>90
>90
AGC GGCC GCT
>90
>90
TTGC GGCC GCAA
>90
>90
Hindlll
CAAGCTT G
CC AAGCTT GG
CCC AAGCTT GGG
0
0
10
0
0
75
Kpnl
GGGTACC C GG GGTACC CC CGG GGTACC CCG
0
>90
>90
0
>90
>90
MluI
GACGCGT C
CGACGCGT CG
0
25
0
50
NcoI
CCCATGG G
CATG CCATGG CATG
0
50
0
75
Ndel
CCATATG G CC CATATG GG CGC CATATG GCG GGGIII CATATG AAACCC GGAATTC CAT ATG GAATTCC GGGAATTC CATATG GAATTCCC
0
0
0
0
75
75
0
0
0i'.
0
>90
>90
Nhel
GGCTAGC C CG GCTAGC CG CTA GCTAGC TAG
0
10
10
0
25 ..
50
酶
寡核甘酸序列
切割率%
2hr
20hr
Notl
TTGCGGCCGC AA
Alli GCGGCCGC IIIA r — ■ ,
AAATAT GCGGCCGC TATAAA
ATAAGAAT GCGGCCGC TAAACTAT
.> \ \ \X/rz-.
AAGGAAAAAA GCGGCCGC AAAAGGAAAA
0
10
10
25
25
0
10
10
90
>90
Nsil
\ 1 1
TGC ATGCAT GCA
CCA ATGCAT TGGTTCTGCAGTT
10
>90
>90
>90
PacI
y .. 1
TTAATTAA
GTTAATTAA C
CC TTAATTAA GG
0
0
0
0
25
>90
Pmel
GIIIAAAC GGIIIAAAC C GGGmAAAC CC AGdU GUTAAAC GGCGCGCCGG
0
0
0
75
0
25
50
>90
PstI
GCTGCAG C TGCA CTGCAG TGCA AACTGCAG AACCAATGCATTGG AAAA CTGCAG CCAATGCATTGGAA CTGCAG AACCAATGCATTGGATGCAT
0
10
>90
>90
0
0
10
>90
>90
0
PvuI
CCGATCG G
0
0
ATCGATCG A