基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究.pdf

中国农业科学院学位论文基于菘夂妥B甲椴庑虻牟枋鱀分子标记开发与应用研究教申请学位类别:农学博士业:茶学单位:茶叶研究所论文编号:博士研究生:王丽鸳指导师:成浩研究员研究培养研究生院提交日期月密级:々
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丑丽鹭汛:尹一年辍卧荐关于论文使用授权的声明性声明少『瓿г卵拱本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定,即:中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名:时间:导师签名:罾:稿:士⑹蒮膇:再宽蔓ǎ坏膡究成簀M猓僦ァ瘆叫:甶黄呤慈艘丫:簘农,郏唬汉搿賗驻阩荽’已孑:鄛瞧着韏学位或讨/⒆匝看酢阥擞的譲緄何膇作厂爱;‘皗.;唬簀
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的⑸德试嘉.%,平均陀幸桓鯯位点,并进一步推算出茶树基因组列的杂合率约为ィ骄个碱基就可能出现一个杂合位点。从龆嗷蚓劾啻刂蟹现了鯯候选位点,设计了对锝蠨测序验证,发现猄候选位点的多态检出率为%。τ眯乱淮咄坎庑蚣际醵圆枋骰ń凶B甲椴庑颍竦貌枋骰ǖ淖B甲樾畔条,ü虮泶锼平/捣植挤治觯⑾植枋骰ǖ淖B甲橐灾械捅泶锓岫鹊幕蛭V鳌>偷鞍资菘釴、和母鍪菘獗榷裕灿条茶树花转录组的蛔⑹汀圆枋骰ㄗB甲楸泶镄畔⒔写笸縎位点的发掘,发现了含的序列条,共,鯯枋骰ㄗB甲橹蠸出现的频率为.%。茶树转录组发现了碱基重复模式,在茶树花的转录组序列中共发现旨罨馗茨J剑罨馗此急壤罡摺茶树转录组所含微卫星序列长度呈偏正态分布,以重复长度小于的讨馗葱蛄凶疃啵长度大于的较长蛄兄馗此诒壤苄远可杓屏,許引物,成功率为.%。本研究对茶树分子标记辅助育种及功能基因的发现等都具有重要的意义。关键词:茶树,镄畔⒀В肿颖昙牵B甲椴庑
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锏目勺R菩浴昙堑挠τ谩肿颖昙堑难芯拷埂肿颖昙堑母攀觥坏愕姆⑾帧中头椒ā昙窃诹帜狙芯恐械挠τ谩立题意义与技术路线⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...⑻⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...;⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..枋鱑数据库构建⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯—⋯⋯⋯⋯⋯.茶树蚐分子标记开发研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯第二章茶树劾嗉癠数据库构建⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯,.●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●●
第三章茶树猄植继卣骷氨昙强7ⅰ材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯猄囊锷杓啤猄引物的初步筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯┰⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.枋鱁—的分布特征⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..枋鱁—锏纳秆讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.匝椴牧稀奶崛┰⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..需样本量的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.结果与分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...ü膊枋鱁数据的冗余性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...枋鱑数据库⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..『对茶树蛄械腟搜寻结果⋯⋯⋯⋯⋯第四章基于肿颖昙堑牟枋鞯胤狡分忠糯ǘ嘌匀⊙%总体遗传多样性所.
锢丛础┰⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯第六章茶树植继卣骷氨昙强7ⅰ材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.牧稀奶崛蛄欣丛醇按怼猄位点搜索⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯┰黾凹觳狻锏那薪捍炕猄位点的分型检测⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯庑蚪峁治觥结果与分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.枋鱁分布特征⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.猄位点的锷杓啤猄引物的筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.猄位点的验证⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..枋鱁—⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.枋鱁的分型⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..玖慷圆枋鞯胤狡分忠糯ǘ嘌圆问倒浪愕挠跋臁锏牡任换蚴钜於砸糯ǘ嘌圆问倒浪愕挠