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研究论文 黄酮类化合物与雌激素受体作用的三维定量构效关系2010 55 2 132 ~ 139
年第卷第期: 《中国科学》杂志社
论文. SCIENCE CHINA PRESS

黄酮类化合物与雌激素受体作用的三维定量
构效关系
邬旸①, 王雍②, 张爱茜①, 于红霞①*, 王连生①
①南京大学环境学院, 污染控制和资源化研究国家重点实验室, 南京 210093;
②中国科学院上海药物研究所, 上海 201203
* 联系人, E-mail: hongxiayu01@
2009-04-27 收稿, 2009-11-23 接受
国家高技术研究发展计划(批准号: 2006AA06Z424)、国家自然科学基金重点项目(批准号: 20737001)资助

摘要黄酮类化合物是一种普遍存在于食物和植物中的内分泌干扰物. 选取 20 个典型的关键词
黄酮类化合物, 采用基于分子对接(docking)FA)和比较分子相黄酮类化合物
SIA)方法, 研究它们与雌激素受体(ERα)的相互作用, 建立了这些黄酮类受体-配体对接
化合物和雌激素受体之间的三维定量构效关系(QSAR)模型, FA 模型的最佳交三维定量构效关系
(3D-QSAR)
互验证相关系数 Q2 为 , 非交互验证相关系数 R2 为 , SIA 模型的
LOO 比较分子场分析
2 2
交互验证相关系数 Q LOO 为 , 非交互验证相关系数 R 为 , 说明模型具有很强的(CoMFA)
稳定性和预测能力. 此外, 分子对接结果揭示了受体腔中的关键残基及其与黄酮类化合比较分子相似性指数
物作用的具体方式. (CoMSIA)


类黄酮是一种广泛存在于植物界的多酚类化合体作用的真实图像, 更深刻地揭示药物-受体相互作
物. 近年来, 研究者发现一些类黄酮化合物能够直接用的机理, 是一种能够基于化合物结构预测其雌激
与人体雌激素受体(ERα)结合, 继而产生类雌激素活素活性, 并能进一步分析毒性作用模式的有力工具[7].
性, 干扰人的正常内分泌功能, 最终导致健康损害[1]. 其中, FA)和比较分子相似
因此, 黄酮类化合物的雌激素活性预测日益受到关 SIA)是建立与研究化合物 3D-QSAR 的
注[2,3]. QSAR 技术为化合物雌激素活性预测提供了快常用技术[8], 它们能通过分析叠合分子周围的三维空
捷途径[4]. Asikainen 等人[5]和 Li 等人[6]分别利用间立场的变化研究化合物与受体分子的相互作用,
kNN(k nearest neighbor) 法和支持向量机(support 揭示化合物生物活性的作用机制, 因此在环境科学
vector machine)法建立了预测雌激素活性的二维定量和生态毒理等领域得到了广泛的应用[9,10]. 如 Tong
结构活性关系(quantitative structure-activity relation- 等人[11,12]和 Waller[10]FA 法分别对不同数据集
ships, QSAR)模型. 雌激素类化合物的活性进行预测, 均得到了具有一
相对于二维的 QSAR 方法, 三维定量构效关系定预测能力的定量模型. 但是这些研究主要侧重雌