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小鼠miR-124a靶基因的初步筛选的综述报告.docx
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小鼠miR-124a靶基因的初步筛选的综述报告.docx
该【小鼠miR-124a靶基因的初步筛选的综述报告 】是由【niuww】上传分享,文档一共【2】页,该文档可以免费在线阅读,需要了解更多关于【小鼠miR-124a靶基因的初步筛选的综述报告 】的内容,可以使用淘豆网的站内搜索功能,选择自己适合的文档,以下文字是截取该文章内的部分文字,如需要获得完整电子版,请下载此文档到您的设备,方便您编辑和打印。小鼠miR-124a靶基因的初步筛选的综述报告miR-124a是一种高度保守的microRNA,在哺乳动物中广泛表达。miR-124a在神经系统中发挥着重要的调节作用,既可以通过抑制转录因子促进神经元分化和成熟,也可以通过抑制DNA***转移酶1(DNMT1)来促进神经元的分化。在肿瘤领域中,miR-124a的表达与多种肿瘤的发生和发展密切相关。因此,研究miR-124a的靶向基因有助于深入了解miR-124a在神经系统和肿瘤中的调节机制。针对miR-124a的靶向基因的初步筛选,一般采用生物信息学方法和实验验证方法相结合的策略。生物信息学方法主要包括序列比对、靶向预测和基因网络分析等。下面将分别介绍这些方法的原理和应用。,主要通过比对miRNA序列和可能的靶向基因的3'UTR序列,寻找具有互补碱基对的区域。一般采用BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)和FASTA(FastAll)等比对工具。BLAST是一种通过局部比对的方式寻找两个序列之间相似度较高的段落,并给出相似度评分的算法。FASTA是一种将序列转换成哈希表,然后通过哈希值进行序列比对的算法。'UTR序列之间的互补碱基对,预测miRNA可能的靶向基因。目前常用的靶向预测工具包括miRanda、TargetScan、PicTar、miRDB等。miRanda通过允许一定程度的mismatch来预测miRNA的靶向基因;TargetScan则综合考虑性状保守性、miRNA-mRNA互补性等多种因素来预测靶向基因;PicTar则通过对miRNA序列和mRNA序列间的保守性分析来预测靶向基因;miRDB则将大量的多项式比对以及支持向量机的方法用于靶向预测。。一般采用3'UTR报告基因表达实验、蛋白质或mRNA表达实验、RNA干扰实验等验证方法。其中,3'UTR报告基因表达实验是最常用的验证方法之一。这种方法通常是将靶向基因的3'UTR区域克隆到荧光素酶报告基因的下游,然后检测miRNA表达对荧光素酶的影响。蛋白质或mRNA表达实验则通过Westernblot或Real-timePCR等方法来检测miRNA表达是否影响靶向基因的蛋白质或mRNA的表达水平。RNA干扰实验则是通过siRNA或shRNA干扰miRNA的表达,来检测靶向基因的表达是否受到影响。除了上述方法外,还可以应用基因网络分析来预测miR-124a靶向基因。基因网络分析可以分析miRNA和靶向基因之间的调控关系,进而预测miRNA的靶向基因。常用的基因网络分析工具包括Cytoscape、IngenuityPathway等。综上所述,针对miR-124a的靶向基因的初步筛选涉及到多种方法的综合使用。这些方法的有效应用,可以帮助我们更全面地了解miR-124a在神经系统和肿瘤中的调节机制。
小鼠miR-124a靶基因的初步筛选的综述报告 来自淘豆网www.taodocs.com转载请标明出处.
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