[硕士论文]中国汉族Graves病候选基因再测序和关联分析.pdf

上海第二医科大学
硕士学位论文
中国汉族Graves病候选基因再测序和关联分析
姓名:孙玲玲
申请学位级别:硕士
专业:遗传学
指导教师:黄薇
20050401
一名力板学位论文独创性声明学位论文使用授权声明学位论文作者签名:议、:埽忽柘发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均已在本人所呈交的学位论文是我在导师的指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含其他个人已经文中作了明确说明并表示谢意。本人完全了解上海第二医科大学有关保留、使用学位论文的规定,学校有权保留学位论文并向国家主管部门或其指定机构送交论文的电子版和纸质版。有权将学位论文用于非赢利目的的少量复制并允许论文进入学校图书馆被查阅。有权将学位论文的内容编入有关数据库进行检索。有权将学位论文的标题和摘要汇编出版。保密的学位论文在解密后适用本规定。日期:
中国汉族病候选基因再测序和关联分析中文摘要病痙,且恢制鞴偬匾煨宰陨砻庖咝约膊。牟因学十分复杂,是遗传和环境因素相互作用的结果。运用全基因组扫描和连锁分析技术,我们实验室报道了湃旧宄け籷与中国汉族人病强烈连锁。本研究,筛查,并分析这些隚〉南喙匦浴5侥壳拔V梗蜓』因策略是除了连锁分析外寻找疾病易感基因的唯一可行方法,该策略根据连锁分析定位克隆结果或病因学臆测等选择候选基因进行进一步研究。候选基因分析最全面的方法是在病例和对照中对基因的全长进行再测序,寻找疾病相关变异。本研究从与定位区域连锁的到细叩黾蚁抵懈魅个样本作为覆檠品,在一≡龊蜓』颍庑┗蚨辔2斡朊庖叻从Φ南赴蛴杌蚝图鬃腺特异性基因。对候选基因的启动子区、外显子区及其临近的内含子区进行直接测序检钡2庑虺ざ任卜⑾个渲衅舳忧鯯,编码区个谋浒被岜嗦氲腟有,内含子区个’非翻译区’和欠译区’分别有龊个’末端’有鯯。所测序列的平均密度为疭,但不同基因以及基因的不同区域,芏炔幌嗤渲斜嗦肭芏我们采用直接测序法,对、、和中的个鼼6哉罩薪谢蚍中秃凸亓7治觥=峁允綢的频率存在显著性差异@肏软件对个高频辛/牡ケ缎虶,腜/和疷/唬疓构成的单倍型诓±楹投哉兆榧浯嬖谙灾圆钜欤琍傻分别为和。其余基因的偷ケ缎驮贕∽楹驼6哉兆榧涞钠德示关。下一步将对这些结果进行进一步功能验证及基因间相互作用研究。在此基础上,对定位区域的候选基因进行单核苷酸多态性基因外显子区的一个低频错义突变疉贕『驼6哉兆榧平衡和单倍型分析,结果蚱舳枨腜/一疉、┙峁崾続和赡苡隚〉囊糯赘行杂最低,约疭。疶、/疌、疷//上海第一二医科大学硕王生学位论文
关键词:病,单核苷酸多态性,候选基因再测序,关联分析上诲第二医科大学碗上生学位论文
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言引一、自身免疫与自身免疫性疾病护机体不受自然界各种因素的损害。正常情况下,免疫系统对宿主自身的组织和细胞不产生免疫应答,这种现象称为自身免疫耐受。自身耐受是维持机体免疫和谐的重要因素,其机制与胚胎期的免疫接触有关。自身免疫是指机体对自身组织成分或细菌抗原失去免疫耐受性,导致免疫效应细胞或自身抗体的产生,并造成自身损害的过程。自身免疫在许多情况下是生理性的,除了防御自然界的损害外,还有机体内部的监视功能,能保护正常组织细胞,清除衰老和突变的细胞,当自身免疫反应超过了生理限度或持续时间过长,造成自身组织的损伤和功能障碍而导致疾病时,则称为自身免疫性疾病。此种病变有的属全身的,有的则仅涉及某些器官。常见的自身免疫病有:系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、多发性硬化、病、吞悄虿⒃⑿匝P“遄像啊⒆陨砻庖咝匀血性贫血、溃疡性结肠炎以及许多种皮肤病等等。自身免疫性疾病具有以下特点:⒒颊哐R褐锌梢约斐龈叩味鹊淖陨砜固搴或胱陨砻庖咦橹煞制鸱从Φ闹旅袅⒒颊咦橹鞴俚牟±硖卣魑C庖哐字ⅲ⑶宜鹕说姆段в胱陨砜固寤蛑旅袅馨拖赴⒂孟嗤乖谀承┦笛槎镏锌筛粗瞥鱿嗨频募膊∧P停⒛芡ü陨砜固寤蛳嘤χ敏淋巴细胞使疾病在同系动物间转移。上述三个特点是自身免疫的三个基本特征,也是确定自身免疫病的三个基本条件。除此之外,目前所认识的自身免疫病往往还具有以下特点:⒍嗍∫虿幻鳎3首苑⑿曰蛱胤⑿裕行┯氩《靖腥净蚍媚忱嘁┪镉泄亍⒉〕桃话憬铣ぃ喑史锤捶⒆骱吐郧ㄑ拥墓蹋∏榈难现爻潭扔胱陨砻庖哂Υ鸪平行关系。⒂幸糯阆颍ǘ喾堑ヒ换蜃饔玫慕峁篐基因在某些自身免疫病中有肯定的作引起自身免疫性疾病的原因和机制非常复杂,目前尚不十分清楚。但根本原因可能是人体的免疫系统包括细胞免疫和体液免疫,正是由于这些免疫系统的存在,才能保针对的抗原分布相对应。⒎⒉〉