freeroi 在功能磁共振roi分析中的应用.ppt

FreeROI在功能磁共振成像ROI分析中的应用黄利皆神经影像计算小组@刘嘉实验室认知神经科学与学****国家重点实验室北京师范大学在应用ROI分析的研究中,ROI的确定方式主要有以下几种根据解剖图谱确定ROI根据功能激活区确定ROI以确定坐标点为中心生成规则ROI前言打开一个terminal输入freeroi,键入回车,开启程序点击File->Openstandardvolume,打开一个结构像FreeROI使用方法FreeROI使用方法图像区:以不同的形式呈现图像在不同的图像显示形式间切换导入新volume;删除已载入的volume;新建空白volume;保存volume数据到文件;FreeROI使用方法改变volume的排列顺序;设置激活值阈限;设置volume显示颜色;显示当前鼠标选择点坐标由脑结构图谱生成ROI载入HarvardOxford-cort-maxprob-thr25-,显示颜色为rainbow。假设我们想针对特定脑区开展研究选中HarvardOxford模板点击工具栏ROItoolset一项,弹出对话框根据需要选择脑区,提取ROI由脑结构模板生成ROI基于当前的研究结果,我们还没有准确的找到大脑功能区和结构脑区之间的对应关系。同时,结构脑区的划分程度相对较粗,一个结构脑区中可能同时包含多个功能脑区。以上问题要求我们,要想获得更加精细的功能脑区,就需要根据功能激活图,选取ROI。ROI的功能一致性利用FSL选取FFA通过手画ROI的操作,我们会发现过程中主要有两个问题画笔的大小不容易选取,很难准确的只把激活区画上;如果要画多个ROI,我们需要自己记住各个ROI的编号,画ROI时容易用错标记值。如何改进当前的工作流程