中文使用说明书.doc

前面的话免费软件的一大特点,就是帮助文件一般较为简单,这个软件包尤为突出,不信选择程序的HELP,你会发现虽然程序功能强大,但帮助文件只有非常简单的一些使用信息,实在令人失望。但你可以在解压出的文件中,,解压在另一个目录,是HTML格式的介绍文件,对软件进行了一些介绍。我花费了大量时间,写出了这篇使用介绍,希望对你的使用有所帮助,更高深的使用只能由自己去挖掘。希望谁有心得,能写出来提供给大家。如果你觉得我介绍的软件与写出的帮助对你的工作非常有帮助,请您寄给我10元钱或者更多,这不仅是对我经济上的资助,这对我也是精神上的鼓励,鼓励我将这个网站继续做下去。毕竟,我的收入是非常有限的,不一定能保证我一直将这个网站继续下去。谢谢。地址:石家庄市华药四区5-3-401谈杰050031生物的化学,就是蛋白质与核酸的化学。对蛋白质的研究是生物化学领域一个非常重要的部分。近年来,通过实施基因组计划,得到了大量的蛋白序列数据,但是,面对如此众多的蛋白质序列数据,其分析工作是一个非常困难的工作。用人工的方法是不可能完成如此大量的分析工作的。运用计算机,利用一定的运算规则,进行蛋白序列分析是唯一的方法。。(InstituteofBiologyandChemistryofProteins)用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容,功能非常强大。应用此软件包,使用个人电脑,便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。感谢软件的编写者,他们将此软件包免费提供给此领域的同行使用,这对于我国的科学技术人员来说,实在是一件好事。因为一个功能再多再好的专业应用软件,如果作为商业软件进行销售的话,往往使大多数需要使用此软件的科技人员因为科研经费的问题,无缘使用,这点在我国尤为突出。软件分为三个版本,分别用于Unix系统,DOS系统与WINDOWS95或98系统,让我以用于WINDOWS系统的版本为例,介绍一下这个软件的基本用法。软件包为一个自解压执行文件,,。执行此文件,输入解压后存放的目录名,便可将所有文件解压在此目录下。主程序名为Anthewin,在桌面上建立它的快捷图标,。通过主程序,我们可以载入蛋白序列,对序列进行编辑、打印、拷贝、改变设定等操作,更重要的是,我们可以在此调用各种所需的分析工具,对蛋白序列进行分析。:可以使用按键或菜单中的File/Open命令打开各种序列文件,程序识别的文件类型包括:单序列文件格式:*.SEQ,(:DNA/Strider格式、EMBL格式、NBRF格式、Pearson/Fasta格式、PIR格式与IG/Stanford格式);含有多个蛋白序列的蛋白数据库文件:*.BAS,(以Pearson/Fasta格式添加序列,上限为30条序列或32K文件大小);ClustalV或ClustalW文件:*.ALN含有ClustalW格式的多队列;:*.MUL;在Prosite蛋白数据库中查寻出Site结果的文件:*.SIT,蛋白质原子空间结构的PDB格式文件:*.PDB;使用IBCP()服务器预测蛋白二级结构所获得的结果文件格式:*.CNS;序列可以从ANTHEPROT编辑窗口以键盘输入,或者以*.SEQ等文件格式载入,也可以从其它文件复制粘贴到编辑窗口。最简单的序列格式为Pearson/Fasta格式,为文本格式文件,带有>开始的为序列蛋白的名称,其后便是蛋白序列。下面为一个此格式的例子:>MBNVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG程序支持的一些编辑功能如下:取消,恢复(Undo):Ctrl+Z。查找Ctrl+T。支持复制与粘贴。可以自定义字符颜色,背景色与打印字体。可打印序列文件。输入或载入序列后,便同时打开了一个图像窗口,以彩图的形式显示出蛋白序列。不同的蛋白残基以不同的颜色表示。下面便是打开一个序列后的主程序窗口的例子:,Methods菜单便被激活,相