鹿蹄橐吾间断分布系统发育地理学案例.pptx

“鹿蹄橐吾系统发育模式和间断分布的研究”文献报告
； ；
Journal of Biogeography (J. Biogeogr.) (2013)
Phylogenetic patterns and disjunct distribution in Ligularia hodgsonii Hook.(Asteraceae)
Jin-Fen g Wang1,2, Xun Gong1*
Key Laboratory of Biodiversity and Biogeography, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences
研究背景
研究内容
实验材料
实验方法
实验结果
讨论
研究背景
中国和日本有很多植物表现出间断分布式样，多数呈间断分布种类主要在中国的东部与日本两地，但也有少数种类分布在中国的中部及西南部与日本。
在中国，鹿蹄橐吾主要围绕四川盆地分布；在日本，鹿蹄橐吾主要分布在本州岛北部和北海道。
两种解释间断分布的模型：长距离扩散；地理分隔
受第四纪冰期影响，日本海形成及扩张导致日本与中国大陆间陆桥反复出现，使两地植物区系得以交流，深刻影响了东亚植物区系的组成。
长距离扩散（ long-distance dispersal ）：通过长距离扩散到适宜的生境而导致的间断分布。
地理分隔（ vicariance ）：曾经广泛分布的物种，由于气候地质等环境因素的变化而导致其分布范围大幅度收缩，并在分布区内产生了地理分隔，从而形成了物种的间断分布。
如长距离扩散所致：甲地区长距离扩散到乙地区：来自甲、乙地区的居群所形成的谱系分支彼此互相交错，不能区分开来，乙地区遗传多样性会比甲地区低。
如地理分隔所致：来自甲、乙两区的居群分别形成两个不同的谱系分布，互为单系，且该物种在两地区间拥有相近的遗传多样性。
长距离扩散理论还是地理分隔理论都会产生不同的遗传信号：
研究内容
鹿蹄橐吾中国—日本间断分布的形成原因，是long-distance dispersal 还是vicariance
种群情况
种群动态
间断分布原因
多样性分析
系统发育分析
分布于中国和日本的鹿蹄橐吾的动态历史过程。
分布于中国和日本的鹿蹄橐吾的分化时间。
实验材料
2008年6月至2009年10月，对分布于中国的鹿蹄橐吾进行广泛野外材料采集，采集23个具代表性居群，围绕四川盆地边缘，云贵高原，横断山脉，秦岭地区，武陵山地区。
日本立教大学博士，本州岛2个居群，北海道4个居群，共29个居群，280个个体。
实验方法
The chloroplast genome(cpDNA)
母系遗传
比核基因拥有更多的变异
较低的基因重组频率
对于鹿蹄橐吾29个居群的280个个体的三个叶绿体DN***段（trnQ–5′rps16；trnL–rpl32；psbA–trnH）进行测序
应用MrBayes 和Beast法建立系统发育关系
应用Statistical dispersal–vicariance analysis (S-DIVA)判断鹿蹄橐吾间断分布原因