TCGA数据库介绍专题
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目录
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前言
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TCGA- THE CANCER GENOME ATLAS
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癌症种类丰富,样本量大
34 kinds of cancer
325 samples on average
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数据产生历程
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TCGA数据的产生历程:
1. 组织样本和临床数据来源网站(TSS)收集的数据发送到Biospecimen核心资源(BCRs)。
2. BCRs提交临床数据和元数据到数据协调中心(DCC)和测序中心(GSCs),获取组织变异数据,然后提交给DCC。
3. GSCs提交跟踪文件,序列比对后文件到癌症基因组学中心(CGHub)。
4. 提交给DCC和CGHub的数据可供研究团队和基因组数据分析中心(GDACs)使用。
5. 分析pipeline以及由GDACs产生的数据结果通过DCC保存到研究社区(community)中。
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barcode解读
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