镜鲤酸性磷酸酶和碱性磷酸酶的QTL+分析.pdf

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答辩委员会成员名单


姓名工作单位职称备注
严云勤东北农业大学教授主席
孙仲武东北林业大学教授委员
滕春波东北林业大学教授委员
张晓锋黑龙江水产研究所副研究员秘书
答辩地点黑龙江水产研究所答辩日期 2012-5-25
上海海洋大学硕士学位论文
镜鲤酸性磷酸酶和碱性磷酸酶的 QTL 分析

摘要

本研究以镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系为材料,利用微卫星(SSR)标
记进行基因组扫描,构建鲤鱼遗传连锁图谱,并采用半同胞家系的分析策略对肠
组织的酸性磷酸酶(ACP)活性和肠肝两组织的碱性磷酸酶(ALP)活性进行了 QTL
定位分析。研究结果如下:
1. 遗传连锁图谱的构建
通过 JoinMap 软件对分子标记进行连锁分析,偏分离标记 315 个,偏分离
比例占 28%,其中 992 个 SSR 标记发生连锁,共组成 51 个连锁群,覆盖基因组总
长度为 ,标记间平均距离为 cM,谱的覆盖率为 %。构建连锁群
中最大的为第 51 连锁群,由 9 个标记组成,图距为 cM;最小连锁群为第 9
连锁群,由 9 个标记组成,图距为 cM;其中第 1 连锁群具有最高分辨率,由
40 个标记覆盖 ,标记间平均距离为 。
QTL 定位
研究
肠组织碱性磷酸酶分析,检测到 2 个与碱性磷酸酶活性相关的 QTL 区间均为
95%染色体水平显著性,其中一个 QTL 位于 LG8(HLJ2634-HLJ3465),95% 置信
区间为0-2cM,可解释表形变异率为 %;另一个 QTL位于 LG13(CA2278-CA246),
95%置信区间为 23-28cM,可解释表形变异率为 7%。
肝脏组织中碱性磷酸酶分析,检测到 2 个与碱性磷酸酶活性相关的 QTL 区间
均为 95%染色体水平显著性,其中一个 QTL 位于 LG8(HLJ1244-2-HLJ1897), 95%
置信区间为 72-76cM , 可解释表形变异率为 % ; 另一个 QTL 位于
LG41(CA642-HLJ495),95%置信区间为 52-54cM,可解释表形变异率为 %。
肠组织酸性磷酸酶分析,检测到 5 个与酸性磷酸酶活性相关的 QTL 区间。与
酸性磷酸酶活性相关的 5 个 QTL 中,1 个 QTL 为 99%基因组水平显著性,位
于 LG28(CA2263-HLJ2873), 99%置信区间为 18-43cM,可解释表型变异率为
%;4 个 QTL 为 95%染色体水平显著性,分别位于 LG2(CA2049-CA2371),
I
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LG14(HLJ3275-CA174)和( CA1276-CA2208)、 LG25(HLJ2941-HLJ3946), 95%
置信区间分别为 0-10cM、84-86cM、96-103cM 和 71-84Cm,可解释表型变异分别为
%、%、%和 %。
3. 肝脏组织碱性磷酸酶活性连锁的微卫星标记的 BLAST 比对结果
通过 BLAST 将与肝脏 ALP 活性相关的 QTL 两端的 SSR 标记与斑马鱼全基因
组序列数据库进行序列比对,取期望值≤1e-10 的基因注释,结果显示:第 8 连锁群
定位的 QTL 区间两端的微卫星标记 HLJ1