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文摘型生物医学数据库



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如是对引起胃癌基因感兴趣的读者,想从事这方面的研究,请问如何查找这方面的信息。能够对这方面的研究动态有一定的了解
国际上权威的核酸序列数据库
(1)欧洲分子生物学实验室的EMBL

(2)美国生物技术信息中心的GenBank .gov/Web/Genbank/
(3)日本遗传研究所的DDBJ
.jp/
“ID”为序列的标识符行,包括登录号、类型,分子的长度
“AC”为登录号行;
“XX”为分隔符号行; “DT”为创建和更新日期行
“DE”为序列描述行;
“KW”为关键字行;
“OG”行描述细胞组织;
“OS”行描述生物体种属;
“OC”行描述生物体分类信息;
“RN”描述参考文献的编号;
“RP”描述参考文献的页码;
“RA”描述参考文献的作者;
“RT”描述参考文献的题目;
“RL”描述参考文献的出处;
“RC”描述参考文献的注解;
“RX”、“DR”行描述交叉引用信息;
“FH”为特征开始符号;
“FT”为特征表行
(1)Feature Key,它是描述域生物功能的关键字;
(2)Location,指明特征在序列中的特定位置;
(3)Qualifiers,描述关于一个特征的辅助信息;
文件体由序列本身所组成,由“SQ”标志的行开始。
序列结束的标记是“//”。
EMBL核酸数据库中的每一个序列数据被赋予一个登录号,它是一个永久性的唯一标识
EMBL的序列数据用外在的ASCII文本文件来表示,
而每一个文件分为文件头和文件体两大部分
文件头由一系列的信息描述行所组成,
文件头实际上对应于一个序列的注释(annotation)

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  • 时间2017-12-28