RNA干扰中小干扰RNA的设计原则.pdf

RNA干扰中小干扰RNA的设计原则.pdf675
扇胖行「扇臨的设计原则
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R34Al006(20lO)050675JD3
摘要:扇怯赡谠葱曰蛲庠葱运碦介导的一种高度保守的序列特异性基因(RNAinduced
RNA(siRNA)RNA
silencing 琑剪
siRNARNAi
RNA(messenger
验时,如何设计高效、特异性抑制靶的是实验成败的关键。
关键词:扇牛恍「扇臨;设计原则琺为底物,由
榈嫉腞聚合酶指
Retardl the ┛ for Small Interfering RNA
獃阹 Yahcheng(Department, ofZunyi Medical CollegeZhuhai siRNA
, 大效果是高效性的原
: a conserved and sequence-specific mechanism
induced small
exogenous endogenousdouble-stranded琾 interfering siRNA
RNA(siRNA)and micmRNA(miRNA)Due its efficiencyhig}lspecificity and stabilityRNAi
has the basic experinlent and treatment diseaseDuringthe — 3
induced the efficient and a
甴 siRNA the key e8sftll . 个水平发挥其作用,其中转
Key 篟 interferenceSmallinterfering RNADesigningnciples
录后水平是主要途径。
RNA(RNAinterferenceRNAi)氡籄激活的结合,随后双链解开,在
发展起来的一项新技术,是将与内源同源的其反义链指导下识别、降解与其同源互补的
小片段外源双链 RNAdsRNA) 1
导入细胞,导致特定基因表达沉默,其中一的 siRNA
RNA(short RNAsiRNA)RNAisiRNAmRNA
RNAisiRNA序列等诸多因素的影响。这就要求实验者在设计
的合理设计和有效转运系统。 siRNA
l 与】阶进行综合分析,优化其序列结构,从而得到较高沉默
早在世纪年代初,现象就于转基因 siRNA
植物的研究中被发现,只是一直无法给出明确的解 2mRNAsi
释。年,等⋯在线虫体内通过实验证实其目前如何识别上的相应靶点尚未
dsRNARNAimRNAsiRNA
后,随着研究的不断深入,认为在植物中发现的共抑重要影响。首先,上部分序列结合的调控蛋
制和转录后基因沉默、真菌中的基因压制等与之相 RISCsiRNARNAi
dsRNAsiRNA
RNAsiRNARNA应避开富有调控蛋白结合区域的潜嗦肭’非
调控机制。曾被认为是真核生物所特有,但最 50100nt1
Makarova157
的方法,通过比对数据库中古细菌和细菌的基 siRNA
因数据,预言了在原核生物中也存在与之类似的 6t7
机制。沉默效果,要避开其单核苷酸多形性区域。另外需
siRNARNAi