序列比对(双序列比对).ppt

运用:
请查询(或搜索)Os11g37990的DNA、mRNA(cDNA)和蛋白质序列。
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实验三:
双序列比对
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一、实验目的
了解使用NCBI上的BLAST工具进行双序列比对。
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二:实验内容及操作步骤
比对两条序列,分析其结果
设置不同的参数进行比对,比较参数所造成的结果差异
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二:实验内容及操作步骤

下载核酸或蛋白质序列分别放在sequence1和sequence2中
核酸使用blastn程序,蛋白使用blastp程序
设置不同罚分值进行比对,比较结果
自己选取2个序列来比对。
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二:实验内容及操作步骤

下载核酸或蛋白质序列分别放在sequence1和sequence2中
核酸使用blastn程序,蛋白使用blastp程序
设置不同罚分值进行比对,比较结果
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三:作业
将以前作业中的基因的DNA序列和cDNA序列下载下来,并运用BLAST2进行比对,根据比对结果将该基因结构示意图画出来。
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