基于NMR自旋弛豫技术的蛋白质动力学研究.pdf

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基于孕谠ゼ际醯蛋白质动力学研究波谱学杂志讳侄ê文引言第卷第年蛋白质是生物体生命活动的基础,广泛参与底物识别、配体结合、信号转导,,目前,数以万计的蛋白质结构得到解析,,越来越多的研究人员却面临一个新的困惑:很多情况下,,这是可以理解摘要:,~的幔运动涉及化学/构象交换过程,常借助和3谠ド⑹侄危贜的蛋白质动力学研究,将蛋白质科学从..中国科学院上海药物研究所生物核磁共振实验室,上海;妹糯笱ЩЩぱг夯镅到峁股镅笛槭遥=:核磁共振坏鞍字剩欢ρВ蛔孕谠中圈分类号:.;文献标识码:收稿日期:一—:收修改稿日期:一’基金项目:ê#缁埃文章编号:作者简介:文榨,四川人,博士研究生,
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,或者说只是一个基态结构,而蛋白质功能的实现往往要求其从基态转变成为激发态,伴随柔性、稳定性、折叠状态、作用界面和能量的改变【.蛋白质在细胞中实际扮演了一个动态角色,通过与时间、,要还原蛋白质在体内的构象变化过程,全面完整地揭示蛋白质的作用机理,,,通常;而且处于激发态的分子比例异常少,,在蛋白质基态与激发态之间架起一座桥梁,~时间尺度的快运动和“、摆动以及侧链的转动等,后者则与配体结合、酶催化、蛋白质折叠、,慢可达陨希阕憧缭搅鍪量级’煌奔涑叨榷杂σ恢只多种实验方法,=:偶极一偶极耦合,灰聘飨蛞煨飨蛲曰灰以及标量偶合相互作用—杂谟刹煌雍薎和槌傻腎孕低常绻雍说淖孕孔数为,,使得局部磁场的空间取向随时间不断发生改变,,所以可以利用弛豫参数这一内在探针来探测蛋白质的动力学特性,因而俗孕谠ナ笛槌晌5鞍字识ρа芯孔钪苯印⒁沧罟惴菏褂玫姆椒ǎ文祚等:基于孕谠ゼ际醯牡鞍字识ρа芯,,四极矩际跛苎芯康牡鞍字誓谠硕氖奔涑上图度骸癮.·“一一一一
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‘茎蠖:篡粤:裳唬、住ⅰ,⋯⋯海ⅰ涣散裕羞,弧翴·/￡称为谱密度函数,表征转动扩散运动频率的相对分布,描述分子内运动对弛豫速率波谱杂第卷~时间尺度的快运动快速内运动对系统熵有非常大的影响,即使是很小的快速内运动改变,也可能导致很大的熵变,引起生物系统中相互作用的发生一鞍字试趐玭奔涑叨鹊哪谠硕比其整体翻转欤耸钡淖孕谠ブ饕@醋訢和四极矩相互作用蛋白质主链自旋弛豫实验原理蛋白质主链酰胺基团约肮羌茈钠矫娴聂驶自旋,是研究~,通过主链酰胺谠ソ械鞍字识ρа芯康挠攀葡而易见邛说淖孕孔邮/谠セ票冉霞虻ィ饕T从贒虲,实验设计和数据分析相对比较简便;一谱中每一个酰胺基团相关峰对应蛋白质一级序列中的一个氨基酸残基,从而可以直接获得蛋白质各个位点的内运动信息;一谱比谱有更高的分辨率;标记蛋白样品的制备成本远低于”昙堑鞍籽罚在实验室坐标系中,∞辏琋轍轓轓唤蠳轓轍轓/,。./叫一,弧轓街校琩一,矗￡;/√恍彩钦婵沾诺悸剩籬是普朗克常数;和分别是和孕拇判龋籸是募ぃ唤蠬和甜。分