《2分钟学会UVP的凝胶电泳分析软件》.doc.doc

2 分钟学会 UVP 的凝胶电泳分析软件在各个论坛上看以过许多凝胶电泳分析的软件,但没有 UVP 使用的 Labwork 的介绍。如果你购买了 UVP 的凝胶电泳拍摄及分析系统,上面就会带一个 la bwork 分析软件。打开这个软件你就可以发现其界面非常熟悉, 原来这就是 Media ics 公司利用 Imageproplus 程序的内核专门应用于分析凝胶电泳图片的软件。上面还有许多 Imageproplus 的功能呢。分析电泳图片还是很简单的,两分钟就能学会,只要在那个 1D-Ge l 工具条从上往下一个一个点开来设置一下就 OK 。打开一个图片后, 先要把图片上的电泳条带摆得横平竖直, 加样孔处于图片上方。这一步只要点第一个菜单 rotate , 然后用鼠标转图片就是。第二步是指定泳道。点 Lanes. 利用弹出的菜单可以删掉或添加泳道, 用鼠标可以拖动泳道位置, 还可以在泳道上下边拖来延长或缩短泳道长度。泳道宽度设置时, 先勾上 Uniform lanes width, 然后在最上面的 lane s width 上把数值加大或减小一些。让选择泳道宽度框全部覆盖住条带。设置完了泳道,再设置条带。占 bands 菜单,在 dark bands bright background 与 bright band dard background 之间选一个, (DNA 凝胶是白带黑背景, 蛋白质凝胶是黑带白背景)min band height 设一个稍大的值, ( 别太小,否则自动找到一大堆条带还得一个个删。) 点一下 find band 。就自动找到一些明显的条带了,用 add 和 delet e band 按纽加上未找到的条带,删掉误识别的条带。这个操作也很简单,点 add band 按纽, 出来一个新对话框, 不理它, 可以在电泳照片上认为该有条带的地方点一下, 就强迫加上了一个条带。还可以在 lane frofile 窗口的曲线上准确找到峰顶位置点一下加上条带。加完后点 OK 回到 band 窗口。注意每个条带也有一个计算范围, 可在曲线上拖它的上下边界。这个边界的选择要仔细。一方面尽量让各条带的范围一致, 另一方面则是选择条带光密度峰的山脚处作为边界。这两者很难同时满足。经常得牺牲一方面。设置完泳道与条带, 下一条是设置背景。前面还有个加样孔位置要设置,因为我们已经把加样孔放到上方了,就不必设置它了。背景的较正方法有许多选择, 但只有一个实用。就是 joining valleys. 上一帖图中峰下面有一根斜线, 那就是背景扣除的界限。下面的面积被扣除。只计算背景线上方的区域作为条带定量的依据。最麻烦的是设置 marker 参数。点 marker 菜单,弹出设置窗口,上面是指定 marker 泳道位置的按纽。系统默认第一泳道为 marker 。但我们