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进化树分析软件MEGA的用法.doc

文档分类：IT计算机 | 页数：约3页举报非法文档有奖

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clustal 排好的序列转成 MEGA 格式 2. 打开 MEGA 格式的文件,点 PHYLOGENY ,要建 BOOTSTRAP 检验的树,如下图。有四种建树方法, NJ, MP , ME , and UPGMA 。后面以 NJ 为例。 3。点击 NJ 后如下图。点击绿色方格可以改变 BOOTSTRAP 中重复的次数(>100), GAP 是 pairwise plete deletion (一般选PAIRWISE) , 适合你数据的替换模型(有MODELTEST可以检验)。(一定要根据自己的数据来设这些值) 4 。一切就绪后,PUTE 。结果如下,红圈中的数字就是 bootstrap 值,一般大于 70%的枝认为比较有意义. 5 。如果有外类群,你可以直接点击你的外类群,得到有根树 6 。基本过程就是这样, MEGA 还有其他一些功能,希望大家继续补充。

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进化树分析软件MEGA的用法.doc

用MEGA构建进化树

用MEGA构建进化树

用MEGA作进化树