现工作单位及职位.doc

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名
纪德彬
性
别
男
出生年月
198308
出生地
山东
婚姻状况
已婚
政治容颜
民众
国
籍
中国
从事专业
化学生物学
现工作单位及职位
CentrillionBioscienceScientist
人事关系所在单位烟台人材中心
学****及工作经历:
(从大学开始填,内容包含时间、单位、学位、所学专业、从事专业、专业技术职务状况,时间段要连续,正确到月份)
199709-200007
莒县安庄高中
200009-200407
临沂大学
生物科学
学士
200409-200707
河北科技大学
药物化学
硕士
200709-201205
中科院大连化学物理研究所
有机化学
博士
201206-201405
University
ofCaliforniaRiverside
博士后
201406-201712
Stanford
University
博士后
201801-201804
Centrillion
Biosciences
Research
Scientist
如内容许多,本栏目填不下时,可另纸接续(下同)。
姓
名
纪德彬
性
别
男
出生年月
198308
出生地
山东
婚姻状况
已婚
政治容颜
民众
国
籍
中国
从事专业
化学生物学
现工作单位及职位
CentrillionBioscienceScientist
人事关系所在单位烟台人材中心
学****及工作经历:
(从大学开始填,内容包含时间、单位、学位、所学专业、从事专业、专业技术职务状况,时间段要连续,正确到月份)
199709-200007
莒县安庄高中
200009-200407
临沂大学
生物科学
学士
200409-200707
河北科技大学
药物化学
硕士
200709-201205
中科院大连化学物理研究所
有机化学
博士
201206-201405
University
ofCaliforniaRiverside
博士后
201406-201712
Stanford
University
博士后
201801-201804
Centrillion
Biosciences
Research
Scientist
如内容许多,本栏目填不下时,可另纸接续(下同)。
利用NAD辅酶近似物成立正交氧化还原系统
申请人在攻读博士学位时期,在赵宗保研究员课题组从事正交氧化还原系统
的成立的研究。独立设计合成了多个NAD辅酶近似物,成立了新式核苷焦磷酸
类化合物的合成方法。成立了苹果酸酶突变体文库,经过挑选获取了NAD近似
物—苹果酸酶突变体组合,从而改变了氧化还原酶的辅酶选择性,使突变的氧化还原酶选择性利用人工合成的辅酶近似物,而该辅酶近似物不可以被未突变的氧化还原酶所鉴别,从而初次创办了生物正交的氧化还原催化系统。发现了氧化还原酶的结构规律,在乳酸脱氢酶和苹果酸脱氢酶的同样位点引入同样的突变,也成
功的改变了其辅酶的选择性。.(2011,133,20857–20862)。后续的工作,利用合***工辅酶在体内成功改变了微生物代谢
通路,调控代谢过程。这一工作发布在ACSCatal.(2017,7,1977–1983)。生物正交氧化还原系统的成立为进一步将生物正交系统整合到代谢通路调控中,用于
合成生物学和化学生物学的研究确定了基础。生物正交催化系统的成立获取了同行的高度议论及大批国内社会媒体的关注,被多篇科学综述介绍和引用。外国同
行在生物化工的顶级综述杂志(TrendsinBiotechnology)中对该研究进行了要点介绍(Mampel,),以为是“thefirststudyaddressingtheissueof
developingtrulyorthogonalmetabolismindependentofcofactorregenerationbythehostcell”
利用核苷酸探针分子检测DNA修复酶和DNA聚合酶活性
申请人博士后时期,,设计合成了
多个核苷酸探针分子,用于对特定基因修复酶或基因突变的解析和检测。细胞内
核苷酸修复酶比方MTH1,dUTPase是重要的癌症靶点。目前,对此类酶活性缺乏一种矫捷快速的解析方法适用于高通量药物挑选。申请人设计合成了相应的探针分子,使酶催化过程中直接产生一分子的ATP,同时利用萤光素酶(firefly
luciferase)对ATP的高矫捷度,实现了对该类酶活性的解析。.(2016,138,9005–9008.)上,并申请了世界专利(PCT/US2017/023856)。利用同样的策略针对癌症靶点酶ITPA和dUTPase设计的探
针分子也获得很好的成效,相关成就分别发布在NucleicAcidsRes.(2017,45,11515–1152)和BioconjugateChem.(2018,29,1614-1621)上。合成的探针分子被世界最大的制药公司诺华利用,合作开发抗癌药物。在诺华的高通量挑选
仪器上,对50000个化合物进行了初始的高通量的挑选,整个挑选过程只用了2mg探针分子,是目前已知对MTH1最矫捷的挑选方法。初次发现了多个小分子化合物
可以激活MTH1的活性,是初次发现小分子化合物可以激活人体内的DNA修复酶。MTH1的激活剂在癌症的预防等领域拥有潜伏的价值,后续的开发工作正在进行中。这一研究发现也遇到美国NIH的一定,获取了后续五年的基金资助
.
(R01CA217809-01)。.
(2018,140,2105–2114)上。
MicroRNA是真核生物体内重要的调控分子,影响细胞周期和生物发育。不依赖PCR和DNA测序技术对MicroRNA的检测是一个重要的研究方向。申请人设计合成了四个不一样碱基的核苷酸与ATP偶联的分子ARNs(ATP-ReleasingNucleotides)。ARNs可以被大多数RNA转录酶和DNA聚合酶鉴别和利用,在酶反应过程中开释大批
的ATP分子,结合利用fireflyluciferase,实现了对MicroRNA的非PCR方法的高
矫捷度检测。本工作因为奇妙的设计和明显的成效,发布在
Ed.(2016,55,2087–2091),并被选为当期的“热门论文”(hotpaper)。进
一步利用合成的探针分子实现了对单位点突变的mRNA的检测,从而用于癌症基因等疾病相关突变的高矫捷和快速的检测。相应的工作已经申请了美国专利(US15/366898)。该成就在癌症初期诊断,个体化医疗检测等方面将有重要的适用价值。
新式核苷酸探针分子用于蛋白质组学的研究
在UCRiverside化学系YinshengWang课题组博士后学****时期,申请人设计合
成了6SGTP亲和探针分子。探针分子与特定蛋白结合后,蛋白的赖氨酸侧链与探针分子反应形成稳固的酰***键,利用生物素的亲和作用,提取全部结合的蛋白,
利用质谱技术进行蛋白质组学的研究,发现了多个6SGTP的特异性结合蛋白
(,86,4550–4558)。申请人利用质谱技术还进行了其余课题的研究,获得了系列研究成就。合成了含有多个含修饰碱基的DN***段,将DN***段连接到质粒后转染到人细胞,解析这些修饰碱基在体内对DNA复制和转录的影
响(,,27,1304–1309;,4,7052)。
利用质谱解析方法,研究了***胞嘧啶氧化产物对多个***转移酶活性的影响
(,10,1749–1752)。利用一步的酶催化方法,取代多步化
学合成方法,合成了含baseJ的DN***段,用于相应的化学生物学研究(
2014,9,e103335;,25,1763–1770)。
.
主要论著目录:
(、题目、期刊名称、年份、卷期、页、总引次数、他引次数、期刊影响因子;
著作:著者、书名、第一版社、年份)
目录列表最后请注明论文总引次数、他引次数、期刊影响因子的盘问截止时间和盘问数
据库。
,BeharryAA,FordJM,Kool,-LinkedNucleotideEnables
LuminescenceSignalingofDamageSurveillancebyMTH1,.
,138,9005–9008.(引用:6IF:)
,MohsenMG,HarcourtEM,Kool,-ReleasingNucleotides:Linking
,55,2087–2091.
(Hotpaper)(引用:7IF:)
JiDB,WangL,HouSH,LiuWJ,WangJX,WangQ,Zhao,
.
,133,20857–20862.(引用:38IF:)
JiDB,StepchenkovaE,CuiJ,MenezesM,PavlovY,Kool,
DeaminatedNucleotideSurveillanceEnzymeITPAActivitywithanATP-releasing
,11515–11524.(引用:2IF:)
,KietrysAM,LeeYJ,Kool,-LinkedChimericNucleotideasa
SpecificLuminescenceReporterofDeoxyuridineTriphosphataseBioconjugateChem.
2018,29,1614–1621.(引用:0IF:)
JiDB,-Containing
OligodeoxyribonucleotidesandanAnalysisoftheImpactofBaseJonDNAReplication
,9,e103335.(引用:2IF:)
JiDB,LinK,SongJK,-inducedOxidationProducts
of5-MethylcytosineonDnmt1-andDNMT3a-,10,1749–1752.(引用:27IF:)
JiDB,YouCJ,WangPC,-InducedOxidationProducts
of5-Methylcytosine
,,
27,1304–1309.(
引用:5IF:)
,WangL,LiuWJ,HouSH,Zhao,
BioorthogonalRredoxSystem.

.

2013,

56,296

–300.(

引用:15IF:
)
JiDB,WangL,ZhouYJ,YangW,WangQ,Zhao,
of
L-Malate
byUsing
aSynthetic
Bioredox
System.
.
2012,
,530–535.
33
(引用:2IF:)

YK,AuldD,
JiDB,
Beharry
AA,KietrysAM,Wilson
DL,JimenezM,King
D,
Nguyen
Z,
Kool,
ET.
Potent
and
SelectiveInhibitors
of8-Oxoguanine
DNA
.
2018,
140,2105–2114.(引用:2IF:)
,LuR,WangPC,YuY,ChenDL,GaoLF,LiuS,
JiDB,RothbartSB,
WangYS,
WangGG,
Song
JK.
Structural
basisforDNMT3A-mediated
denovo
DNA
methylation.
Nature2018,
554,387–391.(引用:5IF:)
WangL,JiDB,LiuYX,WangQ,WangXY,ZhouYJ,ZhangYX,LiuWJ,Zhao,ZB.
SyntheticCofactor-LinkedMetabolicCircuitsforSelectiveEnergyTransfer.

ACS
Catal.

2017,

7,1977

–1983.(引用:8IF:)
,WangP,LiL,WilliamsNL,JiDB,ZahurancikWJ,YouC,WangJ,Suo
Z,.
,45,7276-7284.(引用:1IF:)
YouCJ,JiDB,DaiXX,-mediatedOxidationProducts
of5-Methylcytosine
onDNATranscription
invitroandin
.
2014,
4,7052.(
引用:13IF:)
16.
Xiao
YS,
Ji
DB,
Guo
L,
WangYS.
Comprehensive
Characterization
of
(S)GTP-BindingProteinsbyOrthogonalQuantitative(S)GTP-AffinityProfilingand
(S)GTP/GTPCompetition
Assays.
Anal.
Chem.
2014,
,4550–4558.
(引用:3IF:)
86
17.
HouSH,Ji
DB,
Liu
WJ,WangL,
Zhao,

ofMalicEnzymeMutants
Dependingon1,2,3-TriazoleMoiety-containingNicotinamideAdenineDinucleotide
.
2014,
24,1307–1309.(
引用:5IF:)
18.
Liu
S,
Ji
DB,
Cliffe
L,Sabatini
R,
Wang
YS.
Quantitative
Mass
Spectrometry-Based
Analysis
ofbeta-D-Glucosyl-5-Hydroxymethyluracil
inGenomicDNA
ofTrypanosomabrucei..
.
2014,
25,1763–1770.(引用:
6IF:)
,GuerreroCR,ZhongN,AmatoNJ,LiuYH,LiuS,CaiQ,
JiDB,JinSG,
Niedernhofer,
LJ,
Pfeifer,
GP,
Xu
GL,
Wang
YS.
Tet-Mediated
Formation
of
5-HydroxymethylcytosineinRNA.
.
2014,
136,11582–11585.(引用:
104IF:)
,Williams,
RT,Guerrero
CR,Ji
DB,

of
Electrospray-Produced
Deprotonated
Ions
of
Oligodeoxyribonucleotides
Containing
an
AlkylatedorOxidizedThymidine.
.
2014,
,1167–1176.
25
(引用:1IF:)
WangL,ZhouYJ,JiDB,LinXP,LiuYX,ZhangYX,LiuWJ,Zhao,ZB.
IdentificationofUshAasaMajorEnzymeforNADDegradationin
Escherichiacoli.
.
2014,
59,75–79.(引用:9IF:)
22.
WangL,ZhouYJ,
JiDB,Zhao,
Iintracellular
AqueousVolumeof
Escherichia
coli
Cells.
.
,93,
73–76.(
引用:5IF:)
23.
HouSH,LiuWJ,
JiDB,WangQ,,2,3-TriazoleMoiety
ContainingNADAnalogsandTheirPotentialasRedoxCofactors.
TetrahedronLett.
2011,
,5855–5857.(
引用:11IF:)
52
24.
HouSH,Liu
WJ,
Ji
DB,
Zhao
ZB.
Efficient
Synthesis
of
Triazole
Moiety-containing
Nucleotide
Analogs
andTheirInhibitory
EffectsonaMalic
enzyme.
.
2011,
,1667–1669.(
引用:14IF:)
21
25.
LiuSX,
JiDB,YangYH,ZhenXL,TianX,
EfficientSynthesisofalpha-AminoAcids.
,
6,156–158(引
用:4IF:)
论文总引用次数:290次
盘问截止日期:2018年9月15日
盘问数据库:GoogleScholar
主持(参加)科研项目及申请专利:
(项目本源、项目名称、经费、个人在此中的作用)
参加科研项目:
(NIH)MEASURINGANDMODULATING
OXIDATIVEDNADAMAGESURVEILLANCEPATHWAYS200

万美
元。
以申请人发现的激活DNA修复酶活性的小分子为基础进行的后续研究。
美国国立卫生研究院(NIH)TEMPLATEDCHEMISTRYFORRNAANALYSIS346万美元。参加。
专利:
ETKool,DJi,,898
ETKool,
NUCLEOTIDEPOOLSANITIZINGENZYMESInternationalPCT/US17/23856.
获科技奖状况:
(项目名称、奖项、获奖时间、自己在此中的作用及排名、获奖总人数)
获各种荣誉奖状况: