二代测序4个平台比较illumina&Roche.doc

Illumina与Roche性能比较表IlluminaMiSeqRoche454JuniorIlluminaHiSeq1000RocheGSFLX通量最高通量的个人化测序仪,自动完成从簇生成到测序到数据一级分析和二级分析每此运行可产出300M-:300G的数据量;;读长2x300bp400bp2x100bp450bp运行费用300-1000美元/G的数据量70,000美元/G的数据量60美元/G的数据量20,000美元/G的数据量数据准确性IlluminaSBS测序化学原理是二代测序技术中最被广泛证明和认同的(市场份额和发表文章数量均远超过竞争对手)数据质量不受Homopolymericregions影响>Q20数据质量( >80%数据为Q30)Q20数据质量(如果无重复序列)焦磷酸测序存在homopolymer无法正确读取IlluminaSBS测序化学原理是二代测序技术中最被广泛证明和认同的(市场份额和发表文章数量均远超过竞争对手)数据质量不受Homopolymericregions影响>Q20数据质量 (>80%数据为Q30)Q20数据质量(如果无重复序列)焦磷酸测序存在homopolymer无法正确读取实验周期提供最快的二代测序的实验流程,最快可在8小时内完成从DNA样本建库到数据分析获取全过程。流程包括:文库制备:,使用快速Nextera(1ng上样量)方法在一个仪器系统内、(1X36bp)的时间完成从自动化簇生成到测序全过程整个实验流程需要数天时间,包括:文库制备:1天,且需要大量的手工操作ePCR+Enrichment:在主机外进行,且需要大量手工操作,手动进行。测序:10小时文库制备:。。整个实验流程需要数天时间,包括:文库制备:1天,且需要大量的手工操作ePCR+Enrichment:在主机外进行,且需要大量手工操作,手动进行。测序:10小时IlluminaMiSeqRoche454JuniorIlluminaHiSeq1000RocheGSFLX在一个仪器系统内,以不到2小时的时间完成初级和次级分析2X150bp运行约需24小时2x250bp运行约需35小时应用范围中小基因组的研究:扩增子测序靶向重测序CloneChecking小基因组测序(denove/重测序,<