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聚类分析图解.doc

文档分类：金融/股票/期货 | 页数：约6页举报非法文档有奖

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聚类分析图解.doc:..聚类分析服务修改时间2010-6-1613:50::1•非监督层次聚类目的:用挑选的差异基因的表达悄况來计算样品宜接的相关性。一般來说,同一类样品能通过聚类出现在同一个簇(cluster)中,聚在同一个牍的基因可能具有类似的生物学功能。要求:至少提供3组数抑:进行聚类分析。备注:双通道芯片产生的数据是Cy3通道和Cy5通道的荧光信号比值,即ratio值,Cy3通道倍号和Cy5通道信号在常规实验设计中不能独立分开作为两组单通道倍号值进行数据分析,:肿瘤Ws癌旁1,肿瘤2vsffi旁2•。汀色色时色缺如N閉的齐H:•儿f•.(红色)到低(绿色)变化2•自组织映射聚类SOM目的:按照一个囿定的顺序对若干个样品进行SOM聚类分析,寻找在四个组织内农达模式类似的基因群。要求::XX通道芯片产生的数据是Cy3通道和Cy5通道的荧光信号比值‘。自组织映射聚类SOM结果图。每个趋势用蓝色的折线表示。每个趋势可以通过一个六边形同另外一个趋势连接。六边形的灰度表示相关性系数(correlation)的大小,口色:correlation=1,黑色:correlation=0,灰度表示不同的相关性系数。,每个小图表示一种表达趋势,折线代表这类表达模式的主趋势3•样本主成分分析(PCA)目的:考察样乩的分布怙况,验证实验设计的合理性,生物学至复样品的均一性。要求:至少2组数据。备注:以通道芯片产生的数据足Cy3通道和Cy5通道的荧光信号比值‘rati

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