《基因本体论GeneOntology概览》PPT课件教案模板.ppt

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基因本体论GeneOntology概览
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为什么要建立Gene Ontology
解决生物学定义混乱的现象，使各种数据库中基因产物功能描述相一致
使得在不同生物数据库中的查询具有极高的一致性
允许在各种水平查询基因产物的特性
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Gene Ontology widely adopted
AgBase
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GO(gene ontology)是:
基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库，旨在建立一套适用于各种物种的，对基因和蛋白质功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的语义(terms)词汇标准。
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GO语义的分类
分子功能(Molecular Function)
描述在个体分子生物学上的活性，如催化活性或结合活性。
生物学过程(Biological Process)
由分子功能有序地组成的，具有多个步骤的一个过程。
细胞组件(Cellular Component)
指基因产物位于何种细胞器或基因产物组中(如糙面内质网，核糖体，蛋白酶体等)，即基因产物在什么地方起作用。
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语义信息
id: GO:0043473
name: pigmentation
namespace: biological_process
def: "The deposition or aggregation of coloring matter in an organism, tissue or cell." [GOC:krc]
synonym:None
is_a: GO:0008150
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语义之间的关系
is a、part of
(细胞质)
(细胞器)
(线粒体)
(细胞器膜)
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语义关系之间的推导
is a· is a → is a
part of·part of → part of