freeroi在功能磁共振roi分析中的应用.ppt

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根据解剖图谱确定ROI
根据功能激活区确定ROI
以确定坐标点为中心生成规则ROI
前言
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打开一个terminal
输入freeroi,键入回车,开启程序
点击File->Openstandardvolume,打开一个结构像
FreeROI使用方法
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FreeROI使用方法
图像区:以不同的形式呈现图像
在不同的图像显示形式间切换
导入新volume;
删除已载入的volume;
新建空白volume;
保存volume数据到文件;
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FreeROI使用方法
改变volume的排列顺序;设置激活值阈限;设置volume显示颜色;显示当前鼠标选择点坐标
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由脑结构图谱生成ROI
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载入HarvardOxford-cort-maxprob-thr25-,显示颜色为rainbow。
假设我们想针对特定脑区开展研究
选中HarvardOxford模板
点击工具栏ROItoolset一项,弹出对话框
根据需要选择脑区,提取ROI
由脑结构模板生成ROI
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基于当前的研究结果,我们还没有准确的找到大脑功能区和结构脑区之间的对应关系。
同时,结构脑区的划分程度相对较粗,一个结构脑区中可能同时包含多个功能脑区。
以上问题要求我们,要想获得更加精细的功能脑区,就需要根据功能激活图,选取ROI。
ROI的功能一致性
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利用FSL选取FFA
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通过手画ROI的操作,我们会发现过程中主要有两个问题
画笔的大小不容易选取,很难准确的只把激活区画上;
如果要画多个ROI,我们需要自己记住各个ROI的编号,画ROI时容易用错标记值。
如何改进当前的工作流程
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基于激活图手画ROI
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